实际上,您并没有直接“安装 Bioconda”,而是使用 Conda 从 Bioconda 频道安装您需要的生物信息学软件包。例如,要安装一个名为 bwa 的软件包,您可以使用以下命令: bash conda install -c bioconda bwa 这个命令会从 Bioconda 频道搜索 bwa 包并安装它。如果 bwa 包存在于其他频道(如默认的 main 频道),-c bio...
conda search rmats -c bioconda conda install -c bioconda rmats=4.1.1 conda clean --al conda install -c bioconda rmats=4.1.1 需要仔细查看安装rmats这一个软件,我们的conda需要做的工作 : The following NEW packages will be INSTALLED: _libgcc_mutex anaconda/cloud/conda-forge/linux-64::_libgcc_mut...
如果你看官方文档:https://anaconda.org/bioconda/sra-tools conda install -c bioconda sra-tools conda install -c "bioconda/label/cf201901" sra-tools 上面的两个方式都是可以使用conda安装,但是默认安装的说 sra-tools-2.8.0 : The following packages will be downloaded: package | build ---|---ca-...
如果你看官方文档:https://anaconda.org/bioconda/sra-tools conda install -c bioconda sra-tools conda install -c "bioconda/label/cf201901" sra-tools 上面的两个方式都是可以使用conda安装,但是默认安装的说 sra-tools-2.8.0 : The following packages will be downloaded: package | build ---|--- ca...
$ conda install -c<channel><software> 其中-c这个参数很重要,通过它来指定软件下载的镜像位置 对于我们这些生物信息学的从业人员来说,最常用的channel(这里可以理解成镜像)就是bioconda了,如果想要安装生物信息学,一般都会先到bioconda官网上找一找自己想要的软件在不在bioconda的官方镜像的列表中 ...
conda install -c bioconda blast ##安装过程如下: Collecting package metadata (current_repodata.json): done Solving environment: done ==> WARNING: A newer version of conda exists. <== current version: 4.8.4 latest version: 4.11.0 Please update conda by running ...
conda安装-c bioconda angsd包未找到错误 conda是一个开源的软件包管理系统和环境管理系统,用于安装、运行和管理软件包及其依赖关系。它是Python的一个常用工具,也可以用于其他编程语言。 在使用conda安装软件包时,如果出现"-c bioconda angsd包未找到"的错误,可能是因为没有添加bioconda的软件源。bioconda是一个专门用...
conda install -c bioconda bioconductor-deseq2 conda install --channel https://conda.anaconda.org/BioBuilds r-ggplot2 删除已安装的软件或者包: conda remove -n 环境名 软件名 更新某个软件: conda update 软件名 https://www.cnblogs.com/zhangxingcomeon/p/13801554.html...
因为要使用本地blast 我从conda安装，命令如下：conda install -c bioconda blast 安装过程如下：Collecting package metadata (current_repodata.json): done Solving environment: done ==> WARNING: A newer version of conda exists. <== current version: 4.8.4 latest version:...
$ conda install pkgs-name=version #安装一个包的制定版本 $ conda install -c bioconda-pkgs-name #安装一些较新的bioconda包 $ conda update pkgs-name #更新一个包 $ conda remove pkgs-name #删除一个包 (3) 创建环境与消除环境: $ conda create --name your_env_name #创建一个环境并且指定名字 ...