随后,我们使用细胞模型对PCIF1和CTBP2进行了功能验证,结果表明,CTBP2可能作为PCIF1的关键辅助因子,在HNSCC中发挥关键的分子功能作用。 为了进一步研究PCIF1和CTBP2之间的潜在相互作用,我们使用交联和免疫共沉淀,然后进行高通量测序(CLIP-Seq)来评估这些蛋白结合的mRNA的相似性。通过分析CLIP-Seq数据集,我们观察到PCIF1...
CLIP-Seq,即紫外交联免疫沉淀结合高通量测序(Cross-Linking and Immunoprecipitation High Throughput Sequencing),是一项在全基因组水平揭示RNA与RNA结合蛋白相互作用的革命性技术。 委托科研服务 近年来,该技术广泛应用于miRNA靶标鉴定等研究方向。在动物体内,成熟的单链miRNA与一系列蛋白形成miRNA诱导的沉默复合物(RISC...
2010年,iCLIP建立了新的生成cDNA的方式,能够对截断的cDNA进行扩增,从而通过分析截断的cDNA的起始位点对RNA-蛋白的相互作用位点进行检测。iCLIP之后被进一步改良,如eCLIP、irCLIP。在此之外还有PAR-CLIP 方法 HITS-CLIP/CLIP-SEQ。依赖于UV交联诱导的突变区域来定位蛋白RNA结合位点,通过CIMS(交联诱导的突变位点)分析交联...
CLIP-seq,又称为HITS-CLIP,即紫外交联免疫沉淀结合高通量测序(crosslinking-immunprecipitation and high-throughput sequencing),是一项在全基因组水平揭示RNA分子与RNA结合蛋白相互作用的革命性技术。其主要原理是基于RNA分子与RNA结合蛋白在紫外照射下发生耦联,以RNA结合蛋白的特异性抗体将RNA-蛋白质复合体沉淀之后,回收...
为了帮助大家更好地掌握CLIP-seq实验的基础知识和操作要点,我们特别邀请了高年级的硕博生来分享他们的经验,并设有答疑环节。 本次分享的内容包括: RNA结合蛋白的种类 🌱 CLIP-seq的分类和应用场景 🔬 CLIP-seq的实验步骤及注意事项 📝 如何定制自己的CLIP-seq实验 🎯 在分享结束后,还会有答疑环节,实验中...
CLIP-seq，全称为HITS-CLIP，是一种在全基因组水平揭示RNA分子与RNA结合蛋白相互作用的革命性技术。其核心原理在于RNA分子与RNA结合蛋白在紫外照射下发生耦联，通过RNA结合蛋白的特异性抗体，将RNA-蛋白质复合体进行沉淀，进而回收RNA片段。此过程需经历添加接头、RT-PCR等步骤，最终进行高通量测序。通过生物...
218 -- 2:22 App PAS-seq技术介绍 661 -- 2:19 App MeRIP-seq技术介绍 166 -- 1:47 App Poly(A)-seq技术介绍 1474 -- 2:00 App RNA Pulldown技术介绍 146 -- 2:45 App CUT&TAG测序技术介绍 530 -- 2:20 App PRM靶向蛋白组学定量技术介绍 366 -- 2:01 App 磷酸化蛋白质组技术介...
CLIP-seq,也称为HITS-CLIP,是一种在全基因组水平揭示RNA分子与RNA结合蛋白相互作用的革命性技术。其主要原理是利用紫外照射使RNA分子与RNA结合蛋白发生耦联,然后使用特异性抗体将RNA-蛋白质复合体沉淀,回收其中的RNA片段。经过添加接头、RT-PCR等步骤进行高通量测序,再通过生物信息学的分析和处理,揭示RNA结合蛋白与RNA...
CLIP-seq,又称为HITS-CLIP，即紫外交联免疫沉淀结合高通量测序(crosslinking-immunprecipitation and high-throughput sequencing), 是一项在全基因组水平揭示RNA分子与RNA结合蛋白相互作用的革命性技术。