CLIP-qPCR(crosslinking-immunoprecipitation and qPCR)即紫外交联免疫沉淀结合qPCR定量技术,通过免疫共沉淀RBP-RNA复合物,获取消化(蛋白酶K、DNaseI、RNase T1)后的RNA,并通过对RNA 3’-端加接头和设计不同位点的引物,进行RNA结合蛋白位点的富集效率检测。 CLIP-seq(crosslinking-immunoprecipitation and High throughput...
CLIP-Seq,即紫外交联免疫沉淀结合高通量测序(Cross-Linking and Immunoprecipitation High Throughput Sequencing),是一项在全基因组水平揭示RNA与RNA结合蛋白相互作用的革命性技术。 委托科研服务 近年来,该技术广泛应用于miRNA靶标鉴定等研究方向。在动物体内,成熟的单链miRNA与一系列蛋白形成miRNA诱导的沉默复合物(RISC)...
CLIP-seq,又称为HITS-CLIP,即紫外交联免疫沉淀结合高通量测序(crosslinking-immunprecipitation and high-throughput sequencing),是一项在全基因组水平揭示RNA分子与RNA结合蛋白相互作用的革命性技术。其主要原理是基于RNA分子与RNA结合蛋白在紫外照射下发生耦联,以RNA结合蛋白的特异性抗体将RNA-蛋白质复合体沉淀之后,回收...
Yeo教授团队【2】通过一种名为交联免疫沉淀结合高通量测序(CLIP-seq)的技术,成功地在人胚胎干细胞中构建了细胞类型特异性剪接调节因子FOX2的RNA图谱(图2)。CLIP-seq是一种强大的实验技术,它能够将特定的RNA分子与蛋白质复合物进行高特异性的结合,从而揭示出RNA分子在细胞内的功能和调控机制。这项研究的发现,不仅...
CLIP-seq结合了实验和测序方法,可以研究某种蛋白质在体内的RNA的结合情况。原理为基于RNA和RNA结合蛋白在紫外线照射下发生偶联,再经过蛋白特异性抗体将其沉淀,回收片段,再经添加接头,PCR扩增,进行高通量测序,最后经过生物信息学方法分析和处理得到相应的结果。本篇文章注重讨论后续的生物信息学处理。
小伙伴都知道小编家的明星产品ChIP-seq,通过免疫共沉淀获得蛋白互作的DNA;同样的蛋白和RNA有着千丝万缕的互作关系,获得蛋白结合的RNA就需要我们的RIP-seq & CLIP-seq展现魅力了。 简单来说是通过抗体与靶蛋白进行免疫沉淀反应,将共沉淀下来的RNA分子进行高通量测序。高通量测序作为“科研神队友”,结合传统的免疫沉淀...
CLIP测序1CLIP测序CLIP-Seq(crosslinking-immunprecipitationandhigh-throughputsequencing)即紫外交联免疫沉淀结合高通量测序,通过高通量研究RNA结合蛋白(RBP)在体内与众多RNA靶标的结合模式,并揭示其在一些重要生物学过程中的功能,是一项在全基因组水平揭示RNA分子与RBP相互作用的革命性技术。也被应用到miRNA靶标鉴定、lnc...
小伙伴都知道小编家的明星产品ChIP-seq,通过免疫共沉淀获得蛋白互作的DNA;同样的蛋白和RNA有着千丝万缕的互作关系,获得蛋白结合的RNA就需要我们的RIP-seq & CLIP-seq展现魅力了。 简单来说是通过抗体与靶蛋白进行免疫沉淀反应,将共沉淀下来的RNA分子进行高通量测序。高通量测序作为“科研神队友”,结合传统的免疫沉淀...
必应词典为您提供clip-seq的释义,网络释义: 量测序;结合位点;