可能有以下几个原因: a.抗体特异性问题:所用抗体可能对目标转录因子的特异性不够高,导致结合到非特异性的位点,从而影响后续的motif分析和转录因子的准确预测。 b.数据分析方法的局限性:所采用的motif预测算法…
来自俄罗斯研究人员开发了基因转录调控数据库:GTRD(Gene Transcription Regulation Database),为转录调控研究提供最全面的ChIP-seq实验数据资源,并提供实用的转录因子与靶基因查询功能。其相关研究成果已发表在《Nucleic acids research》。 GTRD数据库内容及其衍生的信息资源 GTRD:基因转录调节数据库 ChIP-seq是一种广泛用于...
ChIP-seq技术在转录因子结合位点预测中的主要作用是()。A.验证已知的转录因子结合位点B.直接鉴定转录因子结合位点C.分析转录因子结合位点的序列特征D.筛选可能的转录因子结合位点的答案是什么.用刷刷题APP,拍照搜索答疑.刷刷题(shuashuati.com)是专业的大学职业搜题找答案
目前而言,以人类和小鼠为例,包含了超过2000种转录因子的20000多例ChIP-seq实验数据。 (3)先前的数据库仅针对转录因子收集的ChIP-seq实验,新版本还包含有关转录共激活因子结合区的数据,以及通过DNase-seq鉴定到的开放染色质区域和TFBSs(DNase 印迹)。 (4)利用HOCOMOCO数据库的位置权重矩阵(position weight matrices)...
ChIP-seq是一种广泛用于识别给定转录因子结合区域的技术。基于全球大量的ChIP-seq数据集积累,已建立了一些专有数据库。但是这些数据库没有集成来自不同ChIP-seq实验数据提供非冗余的转录因子结合位点(TFBSs)集。 为了弥补这个不足,研究人员开发了基因转录调控数据库:GTRD。GTRD从SRA、GEO、ENCODE等公共数据库中收集转录...
ChIP-seq是一种广泛用于识别给定转录因子结合区域的技术。基于全球大量的ChIP-seq数据集积累,已建立了一些专有数据库。但是这些数据库没有集成来自不同ChIP-seq实验数据提供非冗余的转录因子结合位点(TFBSs)集。 为了弥补这个不足,研究人员开发了基因转录调控数据库:GTRD。GTRD从SRA、GEO、ENCODE等公共数据库中收集转录...
ChIP-seq是一种广泛用于识别给定转录因子结合区域的技术。基于全球大量的ChIP-seq数据集积累,已建立了一些专有数据库。但是这些数据库没有集成来自不同ChIP-seq实验数据提供非冗余的转录因子结合位点(TFBSs)集。 为了弥补这个不足,研究人员开发了基因转录调控数据库:GTRD。GTRD从SRA、GEO、ENCODE等公共数据库中收集转录...