由于常规染色质免疫沉淀(ChIP)实验需要的细胞量较多,植物雄性减数分裂细胞的染色质分析尚未完全阐明,导致染色质修饰影响减数分裂基因表达机制仍不清楚。本研究采用的微量细胞ChIP-seq技术(LCNChIP-seq),利用约10000个减数分裂前期Ⅰ的水稻花粉母细胞,绘制了全基因组H3K4me3和H3K27me3的组蛋白修饰图谱,两个标记各设置2个...
Low-Cell ChIP-Seq 数据 为了检测使用低细胞ChIP-Seq试剂盒的效果,我们通过实验比较了使用低细胞ChIP-Seq试剂盒得到的数据和ENCODE的数据。 结果表明,使用5,000个和10,000个细胞分别针对组蛋白修饰蛋白和BRD4蛋白进行ChIP-Seq都得到了与使用20,000,000个细胞得到的ENCODE数据质量相当的结果。 关于抗体 抗体质量是影响...
但是传统的ChIP-Seq需要的百万级的细胞数量才能达到检测要求,而植入前胚胎细胞数量远未达到此数量。 为了更高效地从植入前胚胎细胞全基因组范围内富集H3K4me3和H3K27me3两种组蛋白修饰区域,在本项研究中,研究者采用了一种名为ULI-NChIP的技术,结合高通量测序,第一次在103细胞数量级实现了小鼠植入前胚胎细胞发育各个...
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CUT&Tag需要的细胞起始投入量低,使用试剂盒可以进行低至60个细胞的实验,这是传统的需要百万级细胞起始量的ChIP-Seq所不能及的。2019年,Henikoff团队将CUT&Tag实验首次应用于单细胞,将大量的K562细胞进行CUT&Tag实验,Tn5切割后,通过Takara ICELL8 单细胞分离系统把单个细胞分配到5184 纳米孔中,再加入一组带随机标签...
方法:微量ChIP-seq 摘要 减数分裂(细胞分裂方式)是生物细胞中染色体数目减半的分裂方式,基因转录和染色质结构的重编程在调节植物减数分裂进程具有非常重要的调节作用。由于常规染色质免疫沉淀(ChIP)实验需要的细胞量较多,植物雄性减数分裂细胞的染色质分析尚未完全阐明,导致染色质修饰影响减数分裂基因表达机制仍不清楚。本研...
方法:微量ChIP-seq 摘要: 减数分裂(细胞分裂方式)是生物细胞中染色体数目减半的分裂方式,基因转录和染色质结构的重编程在调节植物减数分裂进程具有非常重要的调节作用。由于常规染色质免疫沉淀(ChIP)实验需要的细胞量较多,植物雄性减数分裂细胞的染色质分析尚未完全阐明,导致染色质修饰影响减数分裂基因表达机制仍不清楚。本...
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方法:微量ChIP-seq 摘要 减数分裂(细胞分裂方式)是生物细胞中染色体数目减半的分裂方式,基因转录和染色质结构的重编程在调节植物减数分裂进程具有非常重要的调节作用。由于常规染色质免疫沉淀(ChIP)实验需要的细胞量较多,植物雄性减数分裂细胞的...
方法:微量ChIP-seq 摘要: 减数分裂(细胞分裂方式)是生物细胞中染色体数目减半的分裂方式,基因转录和染色质结构的重编程在调节植物减数分裂进程具有非常重要的调节作用。由于常规染色质免疫沉淀(ChIP)实验需要的细胞量较多,植物雄性减数分裂细胞的染色质分析尚未完全阐明,导致染色质修饰影响减数分裂基因表达机制仍不清楚。本...