这里需要知道,ChIPseq是可以检测转录因子的结合,也可以检测组蛋白修饰的。而且二者有着截然不同的峰形: 转录因子结合的特征峰: 组蛋白修饰结合的特征峰: 当然我们也可以使用,UCSC基因组浏览器显示。 三、影响测序结果的因素 1、免疫共沉淀的影响 高效特异性抗体 起始物料量 ChIP DNA产量取决于多种因素 细胞类型 标...
Chip-seq是实验前明确有一个感兴趣的转录因子,根据目标转录因子设计抗体去做Chip-seq实验拉DNA,验证感兴趣的转录因子是否与DNA存在相互作用;而ATAC-Seq一般用于不知道特定的转录因子,是在全基因组范围内检测染色质的开放程度,可以得到全基因组范围内的蛋白质可能结合的位点信息,用这个技术方法与其他方法结合是想去筛感...
ChIP-Seq是一种检测细胞内蛋白/DNA互作组的高通量技术。该技术通过联合免疫共沉淀技术和DNA测序技术,对目的蛋白在特定细胞/组织内的互作蛋白/DNA,进行系统的检测和分析。该技术适用于目的蛋白在特定细胞/组织中的蛋白/DNA互作组数据检测,或用于不同遗传背景/实验条件下的互作组差异研究。因此,ChIP-Seq是研究细胞内蛋...
在我司官网http://www.biorun.com/进行注册或登录，请客户按照页面提示填写项目名称、选择项目类型、填写个人信息及联系方式，提交项目所需要的具体信息，包括：1、组织、细胞等样品来源、状态、ChIP检测专用抗体（也可以选择由我司提供）及其他相关信息；2、尽可能丰富的相关资料、文献。实验信息 实验过程中客户可以随...
辉骏生物提供的ChIP染色质免疫共沉淀服务分为以下两种: 1. ChIP qPCR,用于检测某样本中的诱饵蛋白和待测DNA片段是否结合; 2. ChIP seq,用于筛选某样本中的诱饵蛋白可以结合哪些DNA区域。 ChIP(染色质免疫共沉淀)检测服务
1. Peak Calling 为了识别 Myc 转录因子结合区域，我们可以使用peak caller。尽管 R 及更高版本中提供...
文章主要作者曾于2009年开发的SICER算法【1】是ChIP-seq弥散信号分析和检测组蛋白修饰类“宽峰”(broad peak)的有效生物信息学工具。在SICER基础上,作者在RECOGNICER中使用新模型识别ChIP-seq信号的多尺度聚集,适用于寻找基因组上更宽的信号富集区域。目前...
方法:RNA提取、qRT-PCR、RNA-seq、ChIP-seq、TUNEL(通过标记核酸末端检测DNA片段)、免疫印迹。 研究结果: (1)DNA损伤诱导小鼠胸腺和脾脏的p53依赖性细胞凋亡,但不诱导肝脏凋亡 图1:DNA 损伤在胸腺和脾脏中诱导 p53 依赖性细胞凋亡,但不诱导肝脏凋亡,具有共有和组织特异性的 p53 转录反应 ...
ChIP-Seq互作组验证，即在互作组分析筛选的基础上，进一步利用ChIP-qPCR技术对感兴趣分子进行靶向检测，更加精细，也是互作组验证的必由之路。成功验证上岸的基础是理想的互作组数据库和丰富的分析经验，方能事半功倍。广州基云生物，在IP互作组检测和关键机制分子筛选验证领域，具有丰富的经验，助力互作机制研究。如有...
1.高灵敏度:即使转录因子在基因组中的表达水平较低,ChIP-seq也能有效地检测到其结合位点。 2.高特异性:由于使用特定抗体识别目标转录因子,ChIP-seq实验具有较高的特异性。 3.全局视角:ChIP-seq可以揭示转录因子在整个基因组中的结合模式,有助于研究转录因子在不同生理条件下的功能。 4.适用于不同类型生物:ChIP...