用ChIP-seq研究情况,以剖析表观遗传特征的特征和生物学功能。组蛋白标记举例:H3K4me1和H3K27ac(增强子区域)、H3K4me3(启动子区域); ,解析该转录因子作用通路信息; 利用ChIP-seq技术可得到定位图谱,核小体定位在转录调控,DNA复制和修复等多种细胞过程中其中重要作用; 利用ChIP-seq技术可研究DNA甲基化情况,DNA甲基化...
生信基础:ChIP-seq流程与结果解读ChIP-seq实验流程主要包括以下步骤:1. DNA与蛋白质交联: 通过细胞渗透性增强和甲醛处理,目标蛋白与DNA发生交联,随后进行细胞裂解和核DNA提取。2. 染色体片段化: 通过超声破碎或核酸酶消化,将染色体片段化。实验组使用超声产物与抗体-磁珠结合,对照组则直接解交联DNA。3...
ChIP-seq 是一种研究蛋白质与DNA相互作用的技术,其流程涉及多个步骤:交联与提取: 使用甲醛增强细胞通透性,目标蛋白与DNA交联,随后裂解并提取核DNA。片段化与免疫沉淀: DNA通过超声或酶消化片段化,实验组与抗体结合形成复合物,对照组则直接解交联。沉淀后,通过蛋白酶和盐处理去除非特异性片段。测序与...