从下载的sra文件、fq文件(质控)、bowtie2比对、bam文件(bam-QC,check比对率)、MACS(call peaks)、CHIPseeker做peaks的可视化、或者是自己通过bioconductor上的TFBSTool去找相应的高表达的peaks以及regulatory binding sites; 用一张非常简单的chipseq pipeline的示意图来展示一下基本思路: 代码展示如下: ###将SRA 文件...
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