为了确认血浆cfRNA的特征在动态监测癌症患者临床状态中的实用性，研究人员使用先前发表的数据（GSE174302）对143个来自结直肠癌（CRC）和胃腺癌（STAD）患者的cfRNA测序数据集进行了调查。研究人员通过对总cfRNA-seq数据进行解卷积（STAR方法）计算了各种细胞类型的特征得分，并确定它们与癌症分期之间的相关性。研究人员...
如下图所示,与前一代版本产品相比,SMART-Seq Total RNA Pico Input with UMIs(ZapR Mammalian)制备的文库,rRNA 相关 reads 百分比明显降低,外显子 reads 百分比增加! 实验范例:构建 FFPE 样本高品质文库 使用SMART-Seq® Total RNA Pico Input with UMIs(ZapR™ Mammalian)制备 10 ng FFPE RNA 文库(RIN = ...
4.RNA测序(RNA-Seq) –RNA测序技术可以全面而高效地测定CFRNA的转录组,并对其进行定量分析。 –RNA测序通过将RNA逆转录为cDNA,并进行高通量测序,可以获得CFRNA的全面信息,包括序列、表达水平和变异等。 5.质检工具 –还有一些专门用于CFRNA质检的工具,如Agilent Bioanalyzer和LabChip GX等。这些工具可以通过电泳技术...
在发现集中,具有HEBER-seq和PANDORA-seq两项技术,前者可检测cell-free mRNA和lncRNA,后者可检测cell-free miRNA、piRNA、tsRNA和rsRNA,这两项技术全范围覆盖了longRNA以及sncRNA(small non-coding RNA);挖掘新的液体活检生物标志物;在训练集和验证集研究阶段,可提供IPA分析服务以及基于机器学习算法的疾病诊断/预后评...
外泌体miRNA项目文章|近15分外泌体小RNA文章助力医学治疗新思路 http://weixin.qq.com/r/YTkpMcfE4ZqerYNS92xz (二维码自动识别) 上海云序生物科技有限公司 地址: 松江区莘砖公路518号18号2楼 网址:http://www.cloud-seq.com.cn 电话: 021-64878766 邮箱: market@cloud-seq.com.cn...
在发现集阶段,表观生物推出了HEBER-seq和PANDORA-seq两项技术,前者可检测cell-freemRNA和lncRNA,后者可检测cell-free miRNA、piRNA、tsRNA和rsRNA,这两项技术全范围覆盖了longRNA以及small non-coding RNA(sncRNA),挖掘新的液体活检标志物;在训练集和验证集研究阶段,表观生物提供IPA分析服务以及基于机器学习算法的...
同时,RNA-seq数据经不同的生物信息计算方法均发现特定的人类和微生物来源的转录组与特定癌种相关,将两类指标结合在一起对五种常见肿瘤的区分度达到了60-80%。综上,此项研究表明将人源性和微生物源cfRNA结合不仅可以用于早期癌症诊断,还可以区分肿瘤的起源部位。
Researchers studying cystic fibrosis (CF) pathogens have produced numerous RNA-seq datasets which are available in the gene expression omnibus (GEO). Although these studies are publicly available, substantial computational expertise and manual effort are required to compare similar studies, visualize gene...
本研究使用华大研究院自主开发的PALM-Seq技术1,一次实验即可对血浆中的多种RNA进行全谱检测。本课题通过组间差异分析共鉴定出了7个可明显区分新冠患者与健康对照的血浆生物标志物,通过新冠患者中上调的380个基因的通路富集分析发现重症患者的...
3. 肿瘤内异质性(ITH)分析:通过分析不同癌症类型的多部位肿瘤样本,评估公共NJs的空间保守性。使用RNA-seq数据,证明某些NJs在肿瘤内多个部位均有表达,表明这些新抗原是肿瘤广泛存在的。 4. 子类型特异性表达模式:研究了剪接因子表达失调在...