第一步应该建立索引,这没讲清楚。 1. makeblastdb建立索引 2.比对 上面是blastn中的基本参数还有一些可选参数。 在平时使用时,设置常用的基本参数,基本就可以得到比对结果。 blast中有些参数是控制输出时展示比对结果数量的命令,这些是十分重要的,比如只匹配最佳比对序列,或者展示得分最高的几个序列,这些在本地化...
blast+本地化的构建对于流程化处理大量数据序列很方便,blast+是将blast模块化,分为了蛋白质序列比对蛋白数据库(blastp)、核酸序列比对核酸数据库(blastn)、核酸序列比对蛋白质数据库(blastx)、蛋白质比对翻译后的核酸数据库(tblastn)、 翻译后的核酸序列比对翻译后的核酸数据库(tblastx) ...
blast+本地化中blastp操作(基于PDB库)—linux 2019-10-29 15:24 −... wang霏霏 0 5785 linux 定时备份数据库 2019-12-19 18:26 −说明 检查Crontab是否安装 若没有 需要先安装Crontab定时工具 安装定时工具参考(https://www.cnblogs.com/shaohuixia/p/5577738.html) 需要使用root权限 yum -y install...
内容提示: Blast 本地化: window 平台下 blast 软件的安装 boyun 发表于 2009-07-09 17: 08 | 阅读 1 views 1. 对于 windows 2000/xp 用户, 下载 blast-2. 2. 18-ia32-win32. exe 安装文件 ftp: //ftp. ncbi. nlm. nih. gov/blast/executables/LATEST/blast-2. 2. 18-ia32-win32. exe 2....
blast+本地化的构建对于流程化处理大量数据序列很方便,blast+是将blast模块化,分为了蛋白质序列比对蛋白数据库(blastp)、核酸序列比对核酸数据库(blastn)、核酸序列比对蛋白质数据库(blastx)、蛋白质比对翻译后的核酸数据库(tblastn)、 翻译后的核酸序列比对翻译后的核酸数据库(tblastx) BLAST+ 链接地址: ftp://...