生信分析blastp..我用tbtools做blastp的时候,有e-value和得分,这俩分别取多少比较合适哇大佬们,我很纠结,找不到中文有特别注明这俩的,不筛选的话我一个亚家族就有500多个,筛选的话(e-value小于
通常，将E值设为小于10^-5被视为可接受的S值结果。具体而言，假设在相同的数据库下，当E值为0.001时，理论上会有1000条序列可能与目标序列的相似度超过当前S值。而将E值设置为10^-6时，可能仅得到一条最可靠的S值结果。
BLAST中使用的统计值有概率p值和期望e值。 E期望值(E-value)这个数值表示你仅仅因为随机性造成获得这一比对结果的可能次数。这一数值越接近零,发生这一事件的可能性越小。从搜索的角度看,E值越小,比对结果越显著。默认值为10,表示比对结果中将有10个匹配序列是由随机产生,如果比对的统计显著性值(E值)小于该值...
E value为E值。Links从中可以链接到其它数据库的说明,如UniGene,GEO等。 Alignments: Alignments中有各个匹配序列匹配的详细信息。Length:输入序列的长度。Identities:一致性,或相似性,表示匹配的碱基数占总序列长的百分比。也就是两个序列有多少是一样的。Query代表输入序列。Sbjct代表数据库中的序列。Gaps:插入或缺失...
在NCBI-BAST中blast引物序列,其中E-value是5e-04,请问5e-04什么意思, 扫码下载作业帮搜索答疑一搜即得 答案解析 查看更多优质解析 解答一 举报 在数学上E用来表示“科学计数法”,如3.2×10^18 记作 3.2E18,即E=Exponent,指数;幂 解析看不懂?免费查看同类题视频解析查看解答 ...
Blast结果中score, bit-score, p-value, e-value
5.E-value E-value is number of subject sequences that can be expected to be retrieved from the database that have a bit score equal to or greater than the one calculated from the alignment of the query and subject sequence, based on chance alone ,not homology. ...
Query Cover：表示咱们所查询的序列（query）与命中序列的匹配程度（也可理解为覆盖程度）。E value：是期望值或E值，表示当在一个特定大小的数据库中搜索时，我们期望看到多少条序列能够获得同样的得分值，如E=1则可解释为在一个与刚才搜索数据库大小相近的数据库中随机搜索，我们期望还能找到1条与本...
对e-value值的by chance 进行解释 最近在使用blast进行序列检索的时候,有两个比较重要的评价标准,即Max score和e-value: score值很好理解,即根据不同的打分矩阵,对序列间的匹配程度进行打分,得分矩阵比如PAM和BLOSUM(氨基酸): e-value值的概念看起来就相对的比较模糊了,官方的定义是e-value:the number of hits ...
比如8e-16换成常规的数字是什么？