BLAST是指Basic Local Alignment Search Tool,是生物信息学中的一种序列比对算法,用于寻找蛋白质或核酸的相似序列。 下面是一个BLAST结果, 后面有两个值,一个是S值,一个E值。可以发现,结果是依据S值的高低来显示的。 S值表示两序列的同源性,分值越高表明它们之间相似的程度越大。 E值就是S值可靠性的评价。它...
一般的,当我们使用BLAST(是一种用于在数据库当寻找任何蛋白质或者基因序列与你的目标序列一致的程序)时,我们会注意到这里有一个E值。那么这个E value是什么呢?S值表示两序列的同源性,分值越高表明它们之间相似的程度越大。E值就是S值可靠性的评价。它表明在随机的情况下,其它序列与目标序列相似度要大于这条显示...
关于BLAST结果中E-value的说法,以下不正确的是A.它表示了相应hit的可信度B.它可以大于1C.当它确定的时候,相应的p-value也是确定的D.它和一开始输入
最近在使用blast进行序列检索的时候,有两个比较重要的评价标准,即Max score和e-value: score值很好理解,即根据不同的打分矩阵,对序列间的匹配程度进行打分,得分矩阵比如PAM和BLOSUM(氨基酸): e-value值的概念看起来就相对的比较模糊了,官方的定义是e-value:the number of hits you expect to see by chance/false...
BLAST是一种用于生物信息学中蛋白质或核酸序列比对的算法,其结果中包含两个关键值:S值与E值。S值反映两序列间的同源性,数值越高表示相似程度越大。E值则是评价S值可靠性的指标,它表示在随机情况下,其他序列与目标序列的相似度超过S值的概率。因此,E值越低,S值的结果越可信。E值的计算公式为...
在数学上e用来表示科学计数法如321018记作32e18即eexponent指数结果一 题目 在NCBI-BAST中blast引物序列,其中E-value是5e-04,请问5e-04什么意思, 答案 在数学上E用来表示“科学计数法”,如3.2×10^18 记作 3.2E18,即E=Exponent,指数;幂相关推荐 1在NCBI-BAST中blast引物序列,其中E-value是5e-04,请问5e-04...
百度试题 题目关于BLAST结果中E-value的说法,以下不正确的是 相关知识点: 试题来源: 解析 它和一开始输入的查询序列的长度有关 ,但和数据库总序列长度无关 反馈 收藏
BLAST算法的大概思路就是:列表、扫描、延伸。下图是BLAST算法的三个主要处理阶段。 图片来自于刘娟主编 的《生物信息学》 blast算法的简要步骤: 1. 分割并创建列表 将查询序列分割为特定长度的字段“words”,然后创建synonyms字段列表并使用打分矩阵计算得到相应的分数。生成得分高于阈值T的“words”(synonyms)字段列表。
BLAST中,关于E值和Score值描述正确的是A.E值(E-value)表示因为随机性造成获得这一比对结果的可能次数B.E值越大,比对结果越显著C.匹配片段越长、 相似
相似度越高,score越大;E值表示随机匹配的可能性,E值越大,随机匹配的可能性也越大。E值接近零或...