最近在使用blast进行序列检索的时候,有两个比较重要的评价标准,即Max score和e-value: score值很好理解,即根据不同的打分矩阵,对序列间的匹配程度进行打分,得分矩阵比如PAM和BLOSUM(氨基酸): e-value值的概念看起来就相对的比较模糊了,官方的定义是e-value:the number of hits you expect to see by chance/false...
一般的,当我们使用BLAST(是一种用于在数据库当寻找任何蛋白质或者基因序列与你的目标序列一致的程序)时,我们会注意到这里有一个E值。那么这个E-value是什么呢?怎么来理解这个值呢?下面是一个平常的blast结果,Sequences producing significant alignments:Score (S)E gi|83574104|Moth_2374|sporulation – prote...
BLAST中的E值是用于评价S值可靠性的指标。以下是关于E值的详细解释:定义:E值表示在随机情况下,其他序列与目标序列的相似度超过S值的概率。意义:E值越低,说明S值的结果越可信,即两序列间的相似度越有可能是真实的同源关系。计算公式:E值的计算公式为 E=K*mn,其中K和lambda是常数,与数据库...
BLAST是一种用于生物信息学中蛋白质或核酸序列比对的算法,其结果中包含两个关键值:S值与E值。S值反映两序列间的同源性,数值越高表示相似程度越大。E值则是评价S值可靠性的指标,它表示在随机情况下,其他序列与目标序列的相似度超过S值的概率。因此,E值越低,S值的结果越可信。E值的计算公式为...
blast结构的 e-value什么意思一般的,当我们使用BLAST(是一种用于在数据库当寻找任何蛋白质或者基因序列与你的目标序列一致的程序)时,我们会注意到这里有一个E值。那么这个E value是什么呢?S值表示两序列的同源性,分值越高表明它们之间相似的程度越大。E值就是S值可靠性的评价。它表明在随机的情况下,其它序列与...
在数学上e用来表示科学计数法如321018记作32e18即eexponent指数结果一 题目 在NCBI-BAST中blast引物序列,其中E-value是5e-04,请问5e-04什么意思, 答案 在数学上E用来表示“科学计数法”,如3.2×10^18 记作 3.2E18,即E=Exponent,指数;幂相关推荐 1在NCBI-BAST中blast引物序列,其中E-value是5e-04,请问5e-04...
百度试题 题目关于BLAST结果中E-value的说法,以下不正确的是 相关知识点: 试题来源: 解析 它和一开始输入的查询序列的长度有关 ,但和数据库总序列长度无关 反馈 收藏
Query Cover:表示咱们所查询的序列(query)与命中序列的匹配程度(也可理解为覆盖程度)。E value:是期望值或E值,表示当在一个特定大小的数据库中搜索时,我们期望看到多少条序列能够获得同样的得分值,如E=1则可解释为在一个与刚才搜索数据库大小相近的数据库中随机搜索,我们期望还能找到1条与本...
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生信分析blastp..我用tbtools做blastp的时候,有e-value和得分,这俩分别取多少比较合适哇大佬们,我很纠结,找不到中文有特别注明这俩的,不筛选的话我一个亚家族就有500多个,筛选的话(e-value小于