在这篇文章中作者通过单细胞ATAC测序(scATAC-seq)和单细胞RNA测序(scRNA-seq),比较了急性和慢性淋巴细胞性脉络丛脑膜炎病毒(LCMV)感染期间的MBC。主要探讨了慢性病毒感染如何改变MBC的发育,以及这些改变是否可逆,最终鉴定出了一个在慢性感染期间存在的记忆亚群,该亚群富集干扰素刺激基因(ISG)且不同于通常与慢性感染
技术:scRNA-seq 导语 对来自4名AD患者(2名早期阶段,2名晚期)和2名正常对照的PBMC进行scRNA-seq,在AD患者的血液中检测到B细胞显著减少。通过FACS进一步检查了43名AD患者和41名正常受试者的PBMC,发现B细胞的减少与患者的临床痴呆评级(CDR)评分密切相关。在早期AD小鼠中进行了功能实验,显示AD早期B细胞耗竭加速和加重...
B细胞作为免疫系统的核心组成部分,在免疫力方面发挥着重要作用,但它们受到的关注非常少,肿瘤浸润性B细胞(TIB)的组成和功能异质性,没有得到系统检查。 在本研究中,团队收集了大量已发表的TME的scRNA-seq数据集,并将其与新生成的scRNA-s...
为了确定B细胞中Havcr1缺失影响t细胞介导的抗肿瘤反应的机制,研究人员分析了Havcr1基因缺失对B细胞的内在影响。尽管与各自的对照相比,在Havcr1BKO肿瘤、dLN和ndLN中B细胞的总频率没有差异,但来自dLN的Havcr1BKO B细胞的scRNA-seq谱对l型和ll型干扰素的应答特征表...
该研究利用scRNA-seq等技术探索了Bach1(一种抑制抗氧化基因的转录因子)在宿主对结核分枝杆菌(结核病的病原体,Mycobacterium tuberculosis,Mtb)抗性中的作用,发现Bach1高表达与人类活动性肺结核有关。 ② 在感染Mtb的Bach1-/-小鼠中观察到谷胱甘肽水平和Gpx4表达增加,可防止脂质过氧化。Bach1-/-小鼠的巨噬细胞对Mtb...
文章题目：Single-cell RNA sequencing reveals B cell–related molecular biomarkers for Alzheimer’s disease 发表期刊：Experimental & Molecular Medicine 样本类型：4例AD患者（2例早期，2例晚期）和2例正常对照的PBMCs 组学技术：scRNA-seq（共获得46244个细胞）影响因子：8.75 文章简介 本文通过对4例AD患者（...
单细胞转录组测序(scRNA-seq)是在单细胞水平上研究基因表达差异的技术,为细胞异质性研究提供了有力手段。而单细胞ATAC测序(scATAC-seq)是利用转座酶在单细胞水平上研究染色质开放性的技术,可以提供高分辨率的单细胞染色质开放图谱,有助于深入研究细胞异质性的表观遗传调控机理。它们的研究对象一个是mRNA,一个是染色...
接着配对10x scRNA-seq和scATAC-seq 来表征肿瘤浸润性B细胞(TIBs)的表观基因组学,并获得了来自5种癌症类型的9名患者的53,428个肿瘤浸润性B细胞的染色质可及性图谱,包括生发中心途径显性癌症(COAD, THCA, LC和STAD)和滤泡外途径显性癌症(LIHC),通过特征分析,他们确定了B细胞亚群之间共享的和独特的调节模式(图3D...
at-SNE plot of 5′ single-cell RNA (scRNA)-seq from five healthy donors’ peripheral blood B cells. Donor 1: naive B cells,n = 2716; memory B cells,n = 2296; plasma cells,n = 25. Donor 2: naive B cells,n = 350; memory B cells,n = 2711; plasma cells...
伯豪生物全称上海伯豪生物技术有限公司,在生命科学领域为科研工作者提供技术支持及服务、科研试剂产品的公司。主营业务:单细胞测序、单细胞核测序、单细胞ATAC测序、单细胞TCR测序、单细胞BCR测序、空间基因测序、空间转录组测序、FFPE空间转录组测序等,多组学科研技术服