在官网下载数据库时,带有setA 的库为VFDB数据库核心库(set A),而setB为全库(setB), 其中setA仅包含经实验验证过的毒力基因,而setB则在setA的基础上增加了预测的毒力基因,选择好数据库后,直接用blast即可完成注释。 参考文献: Liu B, Pop M. ARDB-Antibiotic Resistance Genes Database. Nucleic Acids Res. ...
[3] Bo L, Mihai P. ARDB--Antibiotic Resistance Genes Database.Nucleic Acids Res. 2009, 37(Database issue): D443-7. [4] Hu Y, Yang X, Qin J,et al. Metagenome-wide analysis of antibiotic resistance genes in a largecohort of human g...