RNA-Seq is used to measure gene and transcript abundance levels, and to assess qualitative information of the transcriptome of all species. It is commonly used to: perform differential expression analysis, iden
RNA-seq检测到新的PTEN-ATAD融合基因的表达。同时还检测到TCF7-CSF1R(图2C)和ETV6-CRX(图2D)两个新的候选T-ALL驱动融合。综上所述,这些数据表明RNA-seq在识别儿童T-ALL中新的融合以及潜在靶向驱动融合方面有独特优势。 图2 T-ALL中的...
他们推测，RNA-Seq已用于发现B-ALL的新分子亚型，也可能成为临床上对B-ALL病例进行诊断分类的有用工具。为了检验这一假设，研究人员通过临床核型分析、荧光原位杂交、染色体微阵列以及下一代测序DNA和RNA融合面板测试，分析了28例已知亚型的B-ALL病例和48例未确定亚型的RNA-Seq数据。RNA-Seq分析准确识别了所有28例已...
CORALL Total RNA-seq文库构建试剂盒 CORALL试剂盒可以在4.5h内快速完成单分子标签(UMIs)以及链特异性(>99%)的RNA文库构建。Lexogen专有的链置换终止和连接技术,无需片段化,可提供完整的转录表达信息,包括转录的起始和终止位点信息。 产品优势: 完整覆盖转录本信息,从起始到终止位点信息,用于全转录组分析; ...
他们推测,RNA-Seq已用于发现B-ALL的新分子亚型,也可能成为临床上对B-ALL病例进行诊断分类的有用工具。 为了检验这一假设,研究人员通过临床核型分析、荧光原位杂交、染色体微阵列以及下一代测序DNA和RNA融合面板测试,分析了28例已知亚型的B-ALL病例和48例未确定亚型的RNA-Seq数据。RNA-Seq分析准确识别了所有28例已知...
其中,768例进行了全基因组测序(WGS),1808例进行了单核苷酸变异测定(SNP),1729例进行了初诊及缓解期样本的全外显子测序(WEG),1889例进行了肿瘤的全转录组测序(RNA-seq)。 结合2754名ALL儿童患者的全基因组、外显子组和转录组测序,...
研究通过 RNA-seq 和 scRNA-seq 综合分析,确定了 9 种与 B-ALL 复发密切相关的 PCD 模式。对其中部分模式涉及的模型基因进行深入研究发现,如细胞凋亡相关的 BIK、BCL2L2 和 WWOX 基因,自噬相关的 TSPO 和 PIP4K2C 基因,坏死性凋亡相关的 MLKL 和 STAT2 基因等,它们在 B-ALL 的发展、耐药及复发过程中发...
基于以上测序平台,华大智造提供从样本提取到数据分析的SEQ ALL全流程工具。同时,华大智造先后推出了多款测序文库制备试剂套装,这些试剂套装与测序仪深度磨合,能够更好地匹配用户的多样化应用场景,涵盖了DNA、外显子组、RNA、甲基化等多种测序文库类型。此外,华大智造提供App系列产品,适配多种接头的文库,兼容性强;可...
华大智造重磅推出升级版时空转录组FF产品方案（fresh frozen冷冻样本）Stereo-seq v1.3和 DNBelab C系列高通量单细胞5'RNA&V(D)J建库试剂盒，以及SEQ ALL全领域应用组合产品，包括即将上市PopOmics大人群多组学组合产品方案，涵盖全基因组测序（WGS）、全基因组甲基化测序（酶转法，WGMS），转录组测序（RNASeq）...
Stranded whole transcriptome RNA-Seq described in this unit captures quantitative expression data for all types of RNA including, but not limited to, miRNA (microRNA), piRNA (-interacting RNA), snoRNA (small nucleolar RNA), lincRNA (large non-coding intergenic RNA), RNA (RNA), tRNA (...