基因分型结果表明,Rice3K56芯片对水稻品种(包括近缘水稻品种)的鉴别非常有效。 采用Rice3K56芯片通过全基因组关联分析(GWAS)进行基因/QTL定位 为了检验Rice3K56芯片通过全基因组关联分析(GWAS)进行基因/QTL定位的有效性,研究中从192份水稻材料中选取了84份材料,初步鉴定出了影响13个重要农艺性状的基因/QTL,因为预测G...
最近, 3000 份水稻重测序项目(3K Rice Genome Project, 3K 水稻基因组项目) 收集了全球 2859 份水稻品种, 这些品 种覆盖了全球不同遗传背景和丰富表 型的水稻资源, 并通过二代基因组测 序技术, 得到了平均 14 倍覆盖深度的 基因组测序数 据[3]. 如何高 效地分析 和整理这些海量的基因组数据, 对利 用...
In this study, haplotype analysis of 120 previously functionally characterized genes, influencing grain yield (87 genes) and grain quality (33 genes) revealed significant variations in the 3K rice genome (RG) panel. For selected genes, meta‐expression analysis using already available datasets along ...
The 3000 rice genomes project between CAAS, BGI and IRRI has given an unprecedented opportunity to better understand the population structure and genetic variation of the staple food for much of humanity. Using 3M filtered SNPs from an updated SNP calling pipeline for Nipponbare IRGSP1.0, all varie...
最近, 3000 份水稻重测序项目(3K Rice Genome Project, 3K 水稻基因组项目)收集了全球 2859 份水稻品种, 这些品种覆盖了全球不同遗传背景和丰富表型的水稻资源, 并通过二代基因组测序技术, 得到了平均 14 倍覆盖深度的基因组测序数据[3]. 如何高效地分析和整理这些海量的基因组数据, 对利用这些基因组信息研究...
最近,3000份水稻重测序项目(3KRice GenomeProject,3K水稻基因组项目) 收集了全球2859份水稻品种,这些品 种覆盖了全球不同遗传背景和丰富表 型的水稻资源,并通过二代基因组测 序技术,得到了平均14倍覆盖深度的 基因组测序数据 [3] .如何高效地分析 和整理这些海量的基因组数据,对利 ...
指导全基因组选择育种有重大的科学 我们获得了包含3000 份不同水稻品种 [4] 最近, 3000 份水稻重测序项目(3K Rice 意义和实用价值 . 的基因组重测序原始数据, 共约 16T. Genome Project, 3K 水稻基因组项目) 单核苷酸多态性(single nucleotide 原始数据通过标准 GATK 分析流程进 [6] [7] 收集了全球 2859 ...
The landscape of gene–CDS–haplotype diversity in rice: Properties, population organization, footprints of domestication and breeding, and implications for genetic improvement 数据地址 也可以用这个单倍型数据和表型做关联分析,用方差分析就可以。表型数据下载 ...
Unlike the genome, the proteome is exquisitely sensitive to cellular conditions and will consist of proteins having abundances dependent upon stage in the ... PK Jensen,L Pa?A-Toli?,GA Anderson,... - 《Analytical Chemistry》 被引量: 535发表: 1999年 Rice proteomics: Ending phase I and the...
The Environmental Effects Assessment Panel (EEAP) is one of three Panels of experts that inform the Parties to the Montreal Protocol. The EEAP focuses on the effects of UV radiation on human health, terrestrial and aquatic ecosystems, air quality, and materials, as well as on the interactive...