最近, 3000 份水稻重测序项目(3K Rice Genome Project, 3K 水稻基因组项目) 收集了全球 2859 份水稻品种, 这些品 种覆盖了全球不同遗传背景和丰富表 型的水稻资源, 并通过二代基因组测 序技术, 得到了平均 14 倍覆盖深度的 基因组测序数 据[3]. 如何高 效地分析 和整理这些海量的基因组数据, 对利 用...
最近, 3000 份水稻重测序项目(3K Rice Genome Project, 3K 水稻基因组项目)收集了全球 2859 份水稻品种, 这些品种覆盖了全球不同遗传背景和丰富表型的水稻资源, 并通过二代基因组测序技术, 得到了平均 14 倍覆盖深度的基因组测序数据[3]. 如何高效地分析和整理这些海量的基因组数据, 对利用这些基因组信息研究...
Both phenotypic data and genotypic data of the 3000 Rice Genome Project (3K-RGP) were downloaded from the Rice SNP-Seek Database (http://snp-seek.irri.org). The full set of phenotypes consisted of 47 agronomic traits recorded in ordinal scale between 1994 and 2010, maintained in the Intern...
The 3000 rice genomes project between CAAS, BGI and IRRI has given an unprecedented opportunity to better understand the population structure and genetic variation of the staple food for much of humanity. Using 3M filtered SNPs from an updated SNP calling pipeline for Nipponbare IRGSP1.0, all varie...
最近,3000份水稻重测序项目(3KRice GenomeProject,3K水稻基因组项目) 收集了全球2859份水稻品种,这些品 种覆盖了全球不同遗传背景和丰富表 型的水稻资源,并通过二代基因组测 序技术,得到了平均14倍覆盖深度的 基因组测序数据 [3] .如何高效地分析 和整理这些海量的基因组数据,对利 ...
指导全基因组选择育种有重大的科学 我们获得了包含3000 份不同水稻品种 [4] 最近, 3000 份水稻重测序项目(3K Rice 意义和实用价值 . 的基因组重测序原始数据, 共约 16T. Genome Project, 3K 水稻基因组项目) 单核苷酸多态性(single nucleotide 原始数据通过标准 GATK 分析流程进 [6] [7] 收集了全球 2859 ...
最近,3000份水稻重测序项目(3KRice GenomeProject,3K水稻基因组项目) 收集了全球2859份水稻品种,这些品 种覆盖了全球不同遗传背景和丰富表 型的水稻资源,并通过二代基因组测 序技术,得到了平均14倍覆盖深度的 基因组测序数据 [3] .如何高效地分析 和整理这些海量的基因组数据,对利 ...
指导全基因组选择育种有重大的科学 我们获得了包含3000 份不同水稻品种 [4] 最近, 3000 份水稻重测序项目(3K Rice 意义和实用价值 . 的基因组重测序原始数据, 共约 16T. Genome Project, 3K 水稻基因组项目) 单核苷酸多态性(single nucleotide 原始数据通过标准 GATK 分析流程进 [6] [7] 收集了全球 2859 ...