最近,单细胞领域文章频频亮相于期刊,其在科研领域的火热程度一路高涨,这不“一波未平一波又起”,10x Genomics新技术—单细胞表面蛋白前来报到! 技术背景 生物膜所含的蛋白叫膜蛋白,是生物膜功能的主要承担者。膜蛋白在生物体的许多生命活动中都扮演着很重要的角色,据估计大约 60% 的药物作用靶点是膜蛋白。通过最新...
针对不同的10xGenomics解决方案(10x单细胞3’V3和10x单细胞5’解决方案),目前为止可以检测的抗体类型如下:(抗体种类持续更新) 10xChromium内部单细胞转录组和表面蛋白检测数据见3’网站https://support.10xgenomics.com/single-cell-gene-expression/datasets和5’网站https://support.10xgenomics.com/single-cell-vdj/...
16年Cell:Perturb-seq 16年Cell:CRISPR-seq 17年Nature Methods:CROP-seq 将CRISPR筛选融入scRNA-seq,在技术上并不容易。CRISPR驱动的扰动需要从RNA聚合酶III(Pol III)特异性U6启动子处,表达高水平的靶向特定基因的单向导RNA(single guide RNA, sgRNA)。但是sgRNA缺少poly(A)尾端,所以其身份不能通过标准scRNA-seq...
作者应用scRNA-seq、CITE-seq技术,结合免疫组化等实验,证实了TAM促进GMB形成的作用,并且验证了新型靶向药物的前景。 研究结果 01 scRNA-seq分析揭示了人类和小鼠GBM免疫图谱 本研究首先是对比初治患者和复发患者的宏观的单细胞测序结果,并且进行细胞分类,发现胶质母细胞瘤肿瘤细胞的构成都是以肿瘤相关巨噬细胞(TAM)为...
在CITE-seq中可使用多少种抗体?我们目前还未确定具体的上限。10x Genomics的研发团队一直与兼容产品合作伙伴BioLegend密切合作,来研究大规模抗体多重分析数据集,其中有一些已创建了200多种抗体的多重分析数据。这个上限可能取决于目前有多少种具有独特且可确定的特异性的抗体这种实际考虑。此外,这个上限可能需要根据具体实...
单细胞测序技术无论是在细胞通量还是测序深度都得到了长足的发展,特别是10x Genomics单细胞测序技术无疑走在了世界前沿。随着研究人员对科学问题的深入挖掘,单纯针对转录组的研究已不能满足研究需求,这对多组学技术工具也提出了更高的要求,...
染色质开放性测序(ATAC-Seq) 细胞表面蛋白鉴定(CITE-Seq/REAP-Seq) 百泰派克生物科技使用10x Genomics Chromium系统结合Illumina平台提供单细胞测序一站式解决方案。您只需提供单细胞悬液,百泰派克生物科技单细胞测序服务为您提供获得高质量测序数据所需的全部服务:包括流式细胞分选、文库制备、测序及数据分析。欢迎免费...
为了确定巨噬细胞亚群之间的保守程度及其在小鼠和人类肝脏之间的不同微环境生态位,我们接下来使用 sc/snRNA-seq 和 CITE-seq 对 19 次肝脏活检生成了人类肝脏的蛋白质基因组图谱。其中,大多数在组织学上是健康的,只有 5 名患者表现出>10% 的肝脂肪变性。细胞比例因所使用的隔离技术而异,虽然患者之间存在一些差异...
10X Genomics platform 10X Genomics 是一个综合的单细胞测序技术平台,可以应用于多种单细胞测序上,包括Single cell gene expression, Single cell Immune Profiling, Single cell CNV, Single cell ATAC。这篇文章将主要简述10X Genomics在单细胞基因表达检测方面,也就是scRNA-seq上的应用。
据悉,10x Genomics现已接受所有发布产品的预订。Chromium Single Cell ATAC Solution预计将于2018年11月交付,而Feature Barcoding技术和改进方案将于2018年12月交付。 想要进一步了解单细胞ATAC-Seq及其他产品的相关信息,请扫描下方二维码观看10x Genomics 在线讲座 ...