对于依赖于完整转录本存在的FT RNA-Seq文库来说,这可能会造成重大问题,而3'-DGE RNA-Seq文库对这种变化的较不敏感。这一优势还表现在一些特殊的样本类型中,在这些样本中无论采用哪种RNA提取方法,都不可能获得高质量的RNA。在这种情况下,3'-DGE RNA-Seq有可能在FT RNA-Seq可能失败的情况下提供良好的差异基因表...
RNA高通量测序（RNA-seq）是转录组测序技术的一种，可以对mRNA、smallRNA和NONcoding RNA等进行测序分析，反映出它们的表达水平。其应用范围包括检测所有mRNA表达量的差异、检测RNA的结构上的差异，以及基因单点突变导致的SNP等。
这使得高通量测序技术在基因组学、转录组学等领域得到了广泛应用。灵活性：高通量测序技术可以应用于多种不同类型的样本和实验设计，例如全基因组测序、外显子测序、RNA-seq等。此外，该技术还可以与多种其他分子生物学技术相结合，如ChIP-seq、甲基化测序等，从而进一步扩展了其应用范围。
瞒不住了!高通量单细胞RNA-Seq,长读长的那种! 在有些研究场景下,长读长测序(long-read sequencing)方法相比传统的短读长测序(short-read sequencing)方法,会是一个更好的选择。长读长测序文库构建操作相对简便。需要多次重复构建文库时,长读长测序也不需面对短读长测序那样复杂繁琐的操作流程。此外,长读长测序...
RNA-Seq简介 举个例子,现在我们有一群正常的神经细胞,一群突变的神经细胞,突变细胞的行为与正常细胞不同。我们想知道是什么遗传机制造成了这种差异,这意味着我们想要观察基因表达的差异。每一个细胞有一堆染色体(chromosomes),每一个染色体上有一堆基因,有一些基因是活跃的,有的是不活跃的,高通量测序告诉我们哪些基...
高通量测试,及RT-qPCR一致性分析 高通量测试(二代)结果基本与RT-qPCR一致性验证的趋势一致,表明测序数据基本可以反映P.indica在不同盐浓度下基因的表达情况 测序数据QC 数据处理步骤如下: (a) remove low-quality bases with Phred score<20 (b) remove ambiguous base ‘N’, and (c) discard short read...
《高通量RNA-Seq测序数据的基因表达水平建模研究》是依托南京航空航天大学，由刘学军担任项目负责人的面上项目。项目摘要 高通量RNA-Seq测序技术近年来大量应用于基因表达水平（GEL）的测量，GEL计算的准确性对后续分析正确得出生物学结论具有至关重要的作用，但该技术中各种系统噪声的存在为GEL的计算带来了挑战。现有方法...
基因捕获灵敏度高 送样量要求 要求细菌数量≥1000万,无明显碎片杂质,结团率≤20%。 分析流程 图3. 分析流程图 文章案例 案例:Droplet-based high-throughput single microbe RNA sequencing by smRandom-seq—基于微液滴的smRandom-seq高通量单微生物RNA测序。 期刊:Nature Communications 时间:2023.08.23 DOI:10.1...
《基于高通量RNA-seq数据转录组拼接的关键技术与算法研究》是依托山东大学，由李国君担任项目负责人的重点项目。中文摘要 研究表明癌症等复杂疾病与转录过程中的可变剪接密切相关，因此认知转录产物的种类、特异性及表达量对于癌症机理研究及临床诊断具有重要意义。高通量的RNA-seq测序技术为揭示和研究真核生物转录组...