RNA高通量测序（RNA-seq）是转录组测序技术的一种，可以对mRNA、smallRNA和NONcoding RNA等进行测序分析，反映出它们的表达水平。其应用范围包括检测所有mRNA表达量的差异、检测RNA的结构上的差异，以及基因单点突变导致的SNP等。
这使得高通量测序技术在基因组学、转录组学等领域得到了广泛应用。灵活性：高通量测序技术可以应用于多种不同类型的样本和实验设计，例如全基因组测序、外显子测序、RNA-seq等。此外，该技术还可以与多种其他分子生物学技术相结合，如ChIP-seq、甲基化测序等，从而进一步扩展了其应用范围。
➢高通量RNA-Seq技术应用及前景 第一代测序技术 1954年，首次利用多聚核糖核苷酸链的降解法实现DNA测序 第一代测序技术主要代表为：sanger法：由于ddNTP的2´和3´都不含羟基，在DNA合成反应中不能形成 磷酸二酯键，因此可以被用来中断DNA合成反应。在4个DNA合成反应体系中分别加入一定比例的带有放射性同位素...
近日,浙江大学郭国骥、梁廷波等研究人员在权威期刊《Advanced Science》上发表了题为“Pan-Cancer Single-Nucleus Total RNA Sequencing Using snHH-Seq”的研究论文,本研究中,研究人员开发了一种高通量、高灵敏度的方法snHH-seq,该方法将随机引物与液滴微流控平台的预索引策略相结合。这种创新的方法允许从临床冷冻样...
《高通量RNA-Seq测序数据的基因表达水平建模研究》是依托南京航空航天大学，由刘学军担任项目负责人的面上项目。项目摘要 高通量RNA-Seq测序技术近年来大量应用于基因表达水平（GEL）的测量，GEL计算的准确性对后续分析正确得出生物学结论具有至关重要的作用，但该技术中各种系统噪声的存在为GEL的计算带来了挑战。现有方法...
高通量m6A甲基化-常量mRNA甲基化测序(MeRIP-seq2) 技术优势: 起始量低:样本起始量可降低至10-20μg,最低仅需1μg总RNA; 转录组范围内:可以同时检测mRNA和lncRNA; 样本要求:可用于动物、植物、细胞及组织的m6A检测; 重复性高:IP富集重复性高,最大化降低抗体富集偏差; ...
RNA-Seq简介 举个例子,现在我们有一群正常的神经细胞,一群突变的神经细胞,突变细胞的行为与正常细胞不同。我们想知道是什么遗传机制造成了这种差异,这意味着我们想要观察基因表达的差异。每一个细胞有一堆染色体(chromosomes),每一个染色体上有一堆基因,有一些基因是活跃的,有的是不活跃的,高通量测序告诉我们哪些基...
曲阜师范大学曹博团队开发了绝对定量RNA测序技术,克服了现有RNA-seq的不足,首次实现了细胞内RNA分子的高通量测序、绝对定量分析、表观修饰定位、代谢片段鉴定等全面组学分析,将推动RNA测序进入绝对定量新时期。 RNA组学研究,即通过对细胞内全部RNA分子进行系统研究,以从整体水平阐明RNA的生物学功能,是多年来后基因组时代...
图1. RNA-seq常规分析流程 叨叨完毕,进入正题。 进入尔云后,打开“测序数据处理”模块,我们会看到图2的结果。在这一模块,我们可以完成RNA-seq数据分析的前两步:1、数据质控和过滤低质量数据;2、基因组组装,计算基因表达量。对于上面两部,尔云又根据是双端测序还是单端测序,分了两块。以edgeR为例,输出的DEGs.tx...