我们知道很多circRNA其实是由exon构成的,exon是有编码能力的,因此我们可以推测很多circRNA应该是有编码蛋白能力的。下图所示的circRNA的其中一个功能就是编码蛋白。 事实上,也已经有文献报道过 ☛circRNA可翻译成蛋白质 那么除了直接检测circRNA的蛋白产物,我们能否大规模的预测circRNA的编码蛋白的能力呢?答案是肯定的。目...
PhyloCSF：通过系统进化保守评分判断序列是否可能编码保守蛋白。CPAT：使用逻辑回归，无需比对，区分编码和非编码转录本，减少误报。IRES相关工具：如IRESite和CircInteractome数据库，用于检测circRNA的内部核糖体进入位点，这些位点对circRNA编码至关重要。Pfam、NetNGlyc、NetOGlyc和NetPhos等工具则用于分析circRNA的...
我们知道很多circRNA其实是由exon构成的,exon是有编码能力的,因此我们可以推测很多circRNA应该是有编码蛋白能力的。下图所示的circRNA的其中一个功能就是编码蛋白。 事实上,也已经有文献报道过 ☛circRNA可翻译成蛋白质 那么除了直接检测circRNA的蛋白产物,我们能否大规模的预测circRNA的编码蛋白的能力呢?答案是肯定的。目...
NetNGlyc 1.0、NetOGlyc 3.1和NetPhos 3.1工具可以预测NG糖基化位点、粘蛋白型O-糖基化位点和磷酸化位点。 CircPro和CircCode建立了集成的生物信息学算法来识别具有蛋白编码潜力的circRNA。 小编后面还会给大家分享其中的一些工具,敬请期待!
我们知道很多circRNA其实是由exon构成的,exon是有编码能力的,因此我们可以推测很多circRNA应该是有编码蛋白能力的。下图所示的circRNA的其中一个功能就是编码蛋白。 事实上,也已经有文献报道过 ☛circRNA可翻译成蛋白质 那么除了直接检测circRNA的蛋白产物,我们能否大规模的预测circRNA的编码蛋白的能力呢?答案是肯定的。目...
下图总结了预测circRNA编码能力的一些生物信息学工具。小编前面已经给大家介绍过其中的ORFfinder和IRESite，这两个工具。这些工具按照其功能大体上可以分为如下三类：1）在分子生物学中，开放阅读框(Open Reading Frame, ORF)从起始密码子开始，是DNA序列中具有编码蛋白质潜能的序列，结束于终止密码子。对于circRNA而言，...
我们知道很多circRNA其实是由exon构成的,exon是有编码能力的,因此我们可以推测很多circRNA应该是有编码蛋白能力的。下图所示的circRNA的其中一个功能就是编码蛋白。 事实上,也已经有文献报道过 ☛circRNA可翻译成蛋白质 那么除了直接检测circRNA的蛋白产物,我们能否大规模的预测circRNA的编码蛋白的能力呢?答案是肯定的。目...
我们知道很多circRNA其实是由exon构成的,exon是有编码能力的,因此我们可以推测很多circRNA应该是有编码蛋白能力的。下图所示的circRNA的其中一个功能就是编码蛋白。 事实上,也已经有文献报道过 ☛circRNA可翻译成蛋白质 那么除了直接检测circRNA的蛋白产物,我们能否大规模的预测circRNA的编码蛋白的能力呢?答案是肯定的。目...