A为对照组，B为处理组。A为对照组，B为处理组，A和B都采用illumina测序，reads读长分别为70bp，插入片段大小为200bp，reads之间的距离为200-70-70=60bp。
时间序列或剂量反应比较:如果组A、B、C代表时间点或剂量水平,可以比较时间或剂量效应,如组A(时间点1)vs 组B(时间点2)vs 组C(时间点3)。 组合比较:可以创建组合的虚拟组,比如将组A和组B的样本合并,然后与组C进行比较,以探究两组间的共同效应或特定效应。 选择哪种比较组合取决于你的研究设计、科学问题和统...
A4:‘样品1 vs 样品2’,则样品1是对照组,样品2是处理组。在相应的结果文件1-vs-2.GeneDiffExp.xls和1-vs-2.GeneDiffExpFilter.xls中,如果一个基因被记为是上调,就表明相对于样品1(对照组),此基因在样品2(处理组)中的表达量是...
GO富集分析结果表明，不同对照组的DE蛋白富集在不同的生物学过程中。
但在原核生物中，由于细菌mRNA丰度低、mRNA 分子缺乏 poly(A) 尾等因素，导致基于ploy(A)的传统scRNA...
如果一个转录组测序项目只有两个分组,那么简单的单次差异分析即可。但是如果有3分组就麻烦了,简单的理解就是两个处理组去和一个对照组差异,然后这两次差异分析的结果可以去对比一下,比如取交集。如下所示的案例: 两次差异分析的结果可以取交集 实际上,在进行差异分析时,如果有三组数据(组A、组B和组C),不仅仅是...
如果一个转录组测序项目只有两个分组,那么简单的单次差异分析即可。但是如果有3分组就麻烦了,简单的理解就是两个处理组去和一个对照组差异,然后这两次差异分析的结果可以去对比一下,比如取交集。如下所示的案例: 两次差异分析的结果可以取交集 实际上,在进行差异分析时,如果有三组数据(组A、组B和组C),不仅仅是...
如果一个转录组测序项目只有两个分组,那么简单的单次差异分析即可。但是如果有3分组就麻烦了,简单的理解就是两个处理组去和一个对照组差异,然后这两次差异分析的结果可以去对比一下,比如取交集。如下所示的案例: 实际上,在进行差异分析时,如果有三组数据(组A、组B和组C),不仅仅是上面的两次差异分析这样的可能...
如果一个转录组测序项目只有两个分组,那么简单的单次差异分析即可。但是如果有3分组就麻烦了,简单的理解就是两个处理组去和一个对照组差异,然后这两次差异分析的结果可以去对比一下,比如取交集。如下所示的案例: 两次差异分析的结果可以取交集 实际上,在进行差异分析时,如果有三组数据(组A、组B和组C),不仅仅是...