对青春期不同阶段相关细胞组成的鉴定和不同细胞间独特的转录特征的表征,有利于特定神经元的分离和对其功能的进一步了解。因此这篇文章利用10× Genomics Visium平台,对雌性SD大鼠出生后25、35、45天的下丘脑进行空间转录组测序,构建弓状核(ARC)基因表达的动态空间图谱。通过比较不同的下丘脑细胞群,揭示了Kiss1+...
空间转录组测序分析显示,R300 治疗的 I/R 小鼠的肾脏中 Pf4、Tgfb1、Acta2 和巨噬细胞特征显著下调。有意思的是,虽然接受 I/R 的肾脏显示出 Pf4 与巨噬细胞特征的 mRNA 共定位增强,但在 R300 治疗组肾脏中明显没有这种现象。与 R300 治疗组相比,IgG 治疗组的多个与巨噬细胞、纤维化和血小板相关的基因上调。
单细胞分析一直是高分热点,单细胞测序技术的研究近年呈指数级增长。 空间转录组是一种通过对固定在芯片上的组织中细胞的转录组进行分析的技术,可以展示该组织不同区域的基因表达变化情况。 那么单细胞测序与空间…
1.10x Visium空间转录组揭示脑卒中小鼠大脑转录景观 研究人员使用10x Visium空间转录组测序对缺血性卒中模型小鼠大脑(PT)和假手术(Sham 对照组)进行实验,获得 19777 个 spots 的转录组数据,然后将每个聚类数据与小鼠的解剖大脑区域对应分析,揭示了缺血小鼠大脑中与不同大脑解剖区域相对应的独特基因图谱(图2)。对空间转...
综上所述,通过单细胞与空间转录组的联合应用,我们可以同时发挥空间转录组空间信息的优势和单细胞分辨率的优势,从多维度全面探究细胞亚群的分布特征、发育分化、相互作用和调控机制。 基迪奥生物在单细胞和空间转录组领域硕果累累,我们不仅拥有丰富的多物种和组织的单细胞/核/原生质体悬液制备经验,为您的实验保驾护航;还...
方法:10× Genomics scRNA-seq(欧易生物单细胞转录组测序)、10×Genomics visium(欧易生物空间转录组测序)研究背景和研究目的 溶瘤病毒(Oncolytic virus, OV)是一类具有复制能力的肿瘤杀伤型病毒,能选择性感染肿瘤细胞,在肿瘤细胞内大量复制并最终摧毁肿瘤细胞,同时激发免疫反应,吸引更多的免疫细胞继续杀死残余的...
2024年2月7日,东南大学姚红红教授和南京航空航天大学姜伟教授共同通讯在 Science Translational Medicine(IF:17.1)在线发表研究论文,利用空间转录组和单细胞转录组测序技术高分辨率地对缺血性卒中模型小鼠大脑的基因表达和细胞互作特征进行了深入解析,并通过细胞外囊泡介导实验验证 LGALS9-CD44 通路在促进卒中后脑修复中的...
单细胞蛋白质组测序是一种通过测定单个细胞的蛋白质来分析其蛋白质组的方法。该技术可以对细胞的蛋白质表达进行分析,从而揭示不同细胞类型之间的差异和相似性,并且可以研究细胞的发育和病理生理学。 二、空间转录组技术 空间转录组技术是一种通过对组织中的基因表达进行空间定位的方法。与单细胞测序技术不同,空间转录...
一、单细胞测序 单细胞测序是指在考察不同细胞之间基因表达差异时,对每一个细胞进行独立的转录组测序。由于每个细胞的基因表达情况可能略有不同,因此单细胞测序能够展现基于细胞个体的高度个性特征。经过单细胞测序后,我们可以获得不同的基因表达图谱,并且精确地解析细胞类型、功能、特征以及细胞生命周期等方面的信息。
重大突破!复旦大学附属中山医院顾建英团队:单细胞测序+空间转录组揭示肿瘤早期传播机制,拿下NC! 在肿瘤领域,单细胞RNA测序(scRNA-seq)和空间转录组学都具有重要的应用,为研究肿瘤的发生、发展和治疗提供了更深入的理解。综合使用这两项技术有助于深入理解肿瘤的分子特征、细胞亚群的动态变化、免疫反应以及药物...