转录组测序过程: 提取RNA; 反转录为cDNA(compliment DNA,只含有DNA的exon); 打碎成短片段(片段越长越难以准确测序); 接头,测序。 名词解释 Read 上述测序过程中读取的短片段数量即为reads Count 理论上来说,基因长度与比对在该基因上的reads数成正比。 Count = 该基因的reads数 / 该基因的长度 优点:考虑了基...
singleton可以说是不能组装的单一read.这个名词是对于454来说的,第一种说法比较正确,因为454的读长较长,拼接不上的单一reads也是有分析价值的.相关推荐 1动物转录组测序数据中,singleton可以说是不能组装的单一read吗?contig是由reads组装而成,那么不能组装的reads是不是就是singletons?即contig和singleton都是unique...
转录组测序中会有one read pair ,two read pairs .read pair 是什么东西啊? 答案 看你的问题,估计是用illumina的高通量测序,进行RNA-seq的研究吧.这个问题其实比较简单:现在的高通量测序,一般分为单端测序(single-end read)和双端测序(paired-end reads).单端测序只测模板DNA的一端,一般有36S...相关推荐 1...
reads)。单端测序只测模板DNA的一端,一般有36SE、50SE两种。而双端测序需要讲模板的两端(3‘和 5’)都测序,一般有90PE,100PE两种,你提的问题应该是指:read-pair one 和 read-pair tow,是一个模板的两端序列。注意,paired-end reads中间的是插入片段,并没有进行测序,但是插入片段长度是...
转录组测序中会有one read pair , two read pairs . read pair 是什么东西啊? 看你的问题,估计是用illumina的高通量测序,进行RNA-seq的研磨雀究吧。这个问题其实比较简单瞎察早:现在的高通量测序,一般分为单端测序(single-endread)和双端测序没局(paired-endreads)
单端测序只测模板DNA的一端,一般有36SE、50SE两种。而双端测序需要讲模板的两端(3‘ 和 5’)都测序,一般有90PE,100PE两种,你提的问题应该是指:read-pair one 和 read-pair tow,是一个模板的两端序列。注意,paired-end reads中间的是插入片段,并没有进行测序,但是插入片段长度是有意义...
单端测序只测模板DNA的一端,一般有36SE、50SE两种.而双端测序需要讲模板的两端(3‘ 和 5’)都测序,一般有90PE,100PE两种,你提的问题应该是指:read-pair one 和 read-pair tow,是一个模板的两端序列.注意,paired-end reads中间的是插入片段,并没有进行测序,但是插入片段长度是有意义的.,8,...
答案解析 查看更多优质解析 解答一 举报 看你的问题,估计是用illumina的高通量测序,进行RNA-seq的研究吧.这个问题其实比较简单:现在的高通量测序,一般分为单端测序(single-end read)和双端测序(paired-end reads).单端测序只测模板DNA的一端,一般有36S... 解析看不懂?免费查看同类题视频解析查看解答 ...