ONT全长转录组测序是指基于ONT纳米孔测序平台进行全长转录组测序的技术。如下图所示，该技术可以通过捕获...
三代全长转录组测序与RNA-seq是两种常用的转录组测序技术,它们在测序原理、应用范围和数据分析等方面存在一些区别。下面我将详细解答你的问题,并逐步解释这两种技术的区别。 1.测序原理: 三代全长转录组测序:三代测序技术主要包括PacBio SMRT(Single Molecule Real-Time)和Oxford Nanopore等。这些技术通过直接测序RNA...
三代全长转录组测序与RNA-seq 在技术原理和数据类型上有显著区别。RNA-seq 通常采用二代测序技术(如 Illumina),生成短序列片段,需要拼接和基因注释来重构转录本,而三代全长转录组测序使用第三代技术(如 PacBio 或 Oxford Nanopore),能够直接测序较长的 RNA 分子,获得完整的转录本。由于三代测序直接提供完整的转...
转录组测序（RNA-seq）的建库过程与原理主要包括实验设计和实际操作步骤。首先，根据研究目标选择合适的策略，如真核生物通常使用oligo dT磁珠富集mRNA，而研究lncRNA或原核生物转录组则需去除rRNA。考虑链特异性，有 stranded 和 un-stranded 两种选择。建库步骤详细如下：总RNA提取：检查纯度、浓度和完整性...
高通量测序 全转录组测序(Total RNA-Seq) 项目介绍 全转录组是指特定细胞在特定状态下所能转录出来的所有RNA的总和,包括mRNA和非编码RNA(non-coding RNA)。针对非编码RNA的研究主要集中在具有调控作用的miRNA,lncRNA和circRNA。 基于二代测序技术的全转录组测序研究,同时分析同一样本中的mRNA,lncRNA,circRNA和miRNA...
真核转录组-mRNA测序(RNA-seq) 有参常规转录组(RNA-Seq) 转录组是某个物种或者特定细胞类型产生的所有RNA,可从整体水平研究基因功能以及基因结构,揭示特定生物学过程以及疾病发生过程中的分子机理,广泛应用于基础研究、临床诊断和药物研发等领域。同时,还能发现未知转录本和稀有转录本,精确地识别可变剪切位点以及cSNP(...
为准确检测宫颈癌和癌前病变,来自法国的研究团队开发了一种名为“HPV RNA-Seq”的检测方法,该方法可以检测高风险人乳头瘤病毒(HPV)多个亚型的基因转录组,也能进行癌前病变的分子标志物检测。初步研究结果表明,该方法的检测性能与病理检测具有可比性,并可减少不必要的侵入性检测。近日,该研究成果在The Journal of ...
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在该讲座中,生工生物高通量测序部首席高级技术主管余纪尖先生将同大家交流高通量测序技术在转录组学研究领域中的实验设计、数据解析以及数据挖掘。 随着高通量测序技术的发展,该技术在转录组学的研究领域已经被广大科研工作者接受。但是,每次转录组测序都会产生大量数据。如何结合实验意图,快速筛选出目标信息,成为广大科研...
不同样品的total RNA中mRNA含量差异较大,若total RNA起始投入量过低,不能保证有足够的mRNA用于后续建库,因此建议RNA起始量为1～4μg。 不同RIN(RNA intergrity number)示意图:(从1～10为bad to good) 由于不完整或降解的total RNA会在测序时产生3‘偏好性,因此建议RIN值≥7。