转录组测序（RNA-Seq，RNA sequencing）是通过高通量测序技术对生物体内全部转录产物（包括mRNA、非编码RNA等）进行测序的技术。转录组测序能够定量检测基因表达、发现新的转录本、分析基因结构变异和识别基因表达调控网络，是揭示基因功能和调控机制的重要手段。一、转录组测序的概念与原理 转录组是指一个细胞、组织或生...
在NovaSeq 6000测序系统测序时,首先会对文库进行芯片制备,目的是将文库DNA(RNA)模板固定到芯片上,在固定DNA模板的过程中,每个DNA(RNA)分子会形成一个簇,一个簇就是一个测序位点,在进行固定过程中极少量的簇与簇之间物理位置会发生重叠,在测序时,测序软件通过前4个碱基对这些重叠的点进行分析和识别,将这些重叠点位...
转录组测序(transcriptome sequencing)是一种利用高通量测序技术来研究转录组的方法,也就是说,它可以用来测定一个特定生物或细胞类型的所有RNA分子。而RNA测序(RNA-seq)是转录组测序的一种,是一种利用深度测序技术特异性地研究转录组中的mRNA(信使RNA)水平的方法。
RNA-seq:RNA-seq是一种第二代测序技术,主要包括Illumina HiSeq和NextSeq等。RNA-seq通过将RNA反转录成cDNA,然后进行扩增和测序,获取RNA的片段序列信息。 2.应用范围: 三代全长转录组测序:由于可以直接测序RNA的全长,三代测序技术在研究转录本的全长变异、剪接异构体和RNA修饰等方面具有优势。它可以提供更全面和准...
小RNA测序将最先进的 Invitrogen™ RNA 技术与全转录组测序方法相结合,专注于细胞的小RNA含量检测 全转录组测序此方法也被称为 RNAseq,具有最大的发现潜力,但是也会带来最大的生物信息学挑战全转录组测序 (RNAseq) 链特异性、无偏好的全转录组分析使得能够鉴定和定量分析已知和新型转录本。将 Ion S5™ 系统...
靶向RNA-Seq 当对一组确定的基因组是感兴趣时,选择一组特定的转录本进行测序通常是可取的。使用全转录组测序无法分析的低表达基因也可以使用靶向RNA-Seq方法检测。 常用的方法有两种,即靶向捕获和扩增子测序。靶向捕获方法涉及使用一组生物素化的探针来选择特定的基因,这些探针结合cDNA,66,75,76或RNA77结合(图1)...
转录组测序(RNA-seq): 首先转录组是指在相同环境(或生理条件)下的在一个细胞、或一群细胞中所能转录出的所有RNA的总和,包括信使RNA(mRNA)、核糖体RNA(rRNA)、转运RNA(tRNA)及非编码RNA。转录组测序(RNA-seq)是将提取所要研究的特定类型的RNA,将其反转录成cDNA,利用高通量测序技术获得某一物种特定组织或器官...
靶向RNAseq(转录组测序技术) 融合基因是癌症发生的主要原因。其快速准确的诊断能够指导临床行动,但是目 前分子诊断方法在分辨率和通量方面都受到抑制。荧光原位杂交 (FISH) 和实时定量聚合酶链反应 (RT-PCR) 尽管敏感度较高,但是只能检测单个融合基因。此外这些方法不能够识别新的融合基因伴侣或者解析复杂的结构重组。
转录组是细胞特定时刻基因表达谱的一个快照,它其实是一个动态的过程,DNA是静态的过程,我们测序只是捕获某一状态下的情况。对于转录组的测序就称为 RNAseq。 1.2 mRNAseq 我们目前的 RNAseq 测序主要就是研究转录出来的 mRNA。关于转录我们都了解中心法则,中心法则的主要内容是,DNA 转录成信使 RNA,然后以这个 mRNA...