转录组测序技术(RNA-seq)作为目前二代测序领域最普遍的技术手段,自从转录组测序问世以来,已经开发了数百种分析工具。根据转录组分析内容可大致将其分析流程分为质控,比对,转录本组装,差异表达分析和差异基因注释。目前,分析的每一步都有很多软件,其软件的性能和分析效率不尽相同。转录组的质控环节较为简单,当去完接...
转录组测序技术（RNA-seq）作为当前二代测序领域广泛应用的方法，已催生出数百种分析工具。转录组分析流程大致分为质控、比对、转录本组装、差异表达分析和差异基因注释等环节。在这篇文章中，我们主要聚焦于比对阶段，特别是以Hisat2软件为例，介绍其在转录组测序比对中的应用与操作。Hisat2是一款高效且...