新一代转录组测序 RNA-Seq (RNA-sequencing) RNA-Seq也称为转录组测序,是最新发展起来的利用新一代测序技术进行转录组分析的技术,可以全面快速地获得特定细胞或组织在某一状态下几乎所有转录本的序列信息和表达信息,包括编码蛋白质的mRNA和各种非编码RNA,基因选择性剪接产生的不同转录本的表达丰度等。在分析转录...
转录组测序(RNA-Seq,RNA sequencing)是通过高通量测序技术对生物体内全部转录产物(包括mRNA、非编码RNA等)进行测序的技术。转录组测序能够定量检测基因表达、发现新的转录本、分析基因结构变异和识别基因表达调控网络,是揭示基因功能和调控机制的重要手段。一、转录组测序的概念与原理 转录组是指一个细胞、组织或生...
一、实验流程 RNA-seq实验流程图 1. RNA样品检测 采用分子生物学先进设备检测RNA样品的纯度、浓度和完整性,以保障使用合格的样品进行转录组测序。 2.RNA文库构建 样品检测合格后,进行文库构建,主要流程如下: (1) 用带有Oligo(dT)的磁珠富集真核生物mRNA; (2) 加入Fragmentation Buffer将mRNA进行随机打断; (3) ...
转录组测序(RNA-Seq)的研究对象是特定细胞在某一功能状态下所能转录出来的所有mRNA的总和。新一代高通量测序技术能够全面快速的获得某一物种特定组织或器官在某一状态下的几乎所有转录本序列信息,从而准确地分析基因表达差异、基因结构变异、筛选分子标记(SNPs或SSR)等生命科学重要问题。
而RNA-seq技术则是近年来兴起的一种高通量测序技术,逐渐替代了传统的microarray技术,成为了研究转录组学的主流方法之一。 二、RNA-seq的原理 1. 测序库构建 在进行RNA-seq实验之前,首先需要构建测序库。通常采用聚合酶链式反应(PCR)或者DNA和RNA的逆转录(Reverse Transcription)来将RNA转录成双链DNA,并添加barcode...
RNA-seq,全称转录组测序技术,简单来说就是用高通量测序技术来分析RNA的表达水平。这个技术能告诉你哪些基因在表达,哪些没有,还能告诉你它们表达的水平有多高。RNA测序最常用来分析差异表达基因(DEG),也就是在不同条件下基因表达量的变化。那么,什么是转录组呢?简单来说,转录组就是某个物种或者特定细胞类型在某一...
长读长RNA测序技术(long-read RNA-seq technologies, lrRNA-seq)的兴起引发了对其全面评估的需求。为了评估长读长方法在转录组分析中的有效性,长读长RNA测序基因组注释评估项目(Long-read RNA-Seq Genome Annotation Assessment Project,LR...
转录组测序(RNA-seq)技术 转录组是某个物种或者特定细胞类型产生的所有转录本的集合。转录组研究能够从整体水平研究基因功能以及基因结构,揭示特定生物学过程以及疾病发生过程中的分子机理,已广泛应用于基础研究、临床诊断和药物研发等领域。基于Illumina高通量测序平台的转录组测序技术使能够在单核苷酸水平对任意物种的...
转录组测序是一个广泛的术语,包含了多种不同类型的RNA分子的测序,而RNA-seq更专注于分析mRNA。这两种技术都可以用来研究基因表达,但是转录组测序可以提供更全面的RNA样本分析,包括非编码RNA,而RNA-seq主要是研究编码蛋白的mRNA。