转录组测序（RNA-Seq，RNA sequencing）是通过高通量测序技术对生物体内全部转录产物（包括mRNA、非编码RNA等）进行测序的技术。转录组测序能够定量检测基因表达、发现新的转录本、分析基因结构变异和识别基因表达调控网络，是揭示基因功能和调控机制的重要手段。一、转录组测序的概念与原理 转录组是指一个细胞、组织或生...
而RNA-seq技术则是近年来兴起的一种高通量测序技术,逐渐替代了传统的microarray技术,成为了研究转录组学的主流方法之一。 二、RNA-seq的原理 1. 测序库构建 在进行RNA-seq实验之前,首先需要构建测序库。通常采用聚合酶链式反应(PCR)或者DNA和RNA的逆转录(Reverse Transcription)来将RNA转录成双链DNA,并添加barcode...
其中一些方法使用oligo(dT)启动RT或测序,如PAS-Seq, polyA-Seq, 3'T-fill等。这种方法的一个问题是,内部poly(A)引物可以产生高频率的截断cDNA。其他方法,如3P-Seq和3 ' reads,使用基于RNA的连接来捕获3 '端片段。虽然这些方法成功地解决了内部引物问题,但RNA连接酶的序列偏好可能会带来偏差。同样值得注意的是...
转录组测序（RNA-seq）技术 转录组是某个物种或者特定细胞类型产生的所有转录本的集合。转录组研究能够从整体水平研究基因功能以及基因结构，揭示特定生物学过程以及疾病发生过程中的分子机理，已广泛应用于基础研究、临床诊断和药物研发等领域。基于Illumina高通量测序平台的转录组测序技术使能够在单核苷酸水平对任意物种的...
通过对多个细胞系进行检测分析,靶向RNA-seq方法在检测融合基因上更有优势,例如EWSR1-FLI1。同时在两例肺癌患者肿瘤组织中发现,靶向RNA-seq不仅能够确认ROS1和ALK的重组现象,同时能够确定其伴侣基因以及融合连接位点 (图 2)。提高融合基因检测率,并且与之前的诊断具有高度一致性。
单细胞测序分为低通量单细胞测序,和海量单细胞测序,低通量测序就如上边的smartseq 2 的技术,当细胞非常少的时候可以看不同细胞之间的差异性,如果当细胞很多时候我们想研究很多个细胞中每个细胞的基因表达量的时候可以做海量单细胞测序,海量单细胞测序和低通量的单细胞测序相比,价格便宜很多,但是目前主流的海量单细胞测...
RNA-seq:RNA-seq是一种第二代测序技术,主要包括Illumina HiSeq和NextSeq等。RNA-seq通过将RNA反转录成cDNA,然后进行扩增和测序,获取RNA的片段序列信息。 2.应用范围: 三代全长转录组测序:由于可以直接测序RNA的全长,三代测序技术在研究转录本的全长变异、剪接异构体和RNA修饰等方面具有优势。它可以提供更全面和准...
RNA-seq,全称转录组测序技术,简单来说就是用高通量测序技术来分析RNA的表达水平。这个技术能告诉你哪些基因在表达,哪些没有,还能告诉你它们表达的水平有多高。RNA测序最常用来分析差异表达基因(DEG),也就是在不同条件下基因表达量的变化。那么,什么是转录组呢?简单来说,转录组就是某个物种或者特定细胞类型在某一...
转录组测序(transcriptome sequencing)是一种利用高通量测序技术来研究转录组的方法,也就是说,它可以用来测定一个特定生物或细胞类型的所有RNA分子。而RNA测序(RNA-seq)是转录组测序的一种,是一种利用深度测序技术特异性地研究转录组中的mRNA(信使RNA)水平的方法。