转录组/蛋白组+代谢联合分析策略包括: (1)代谢物和编码代谢物的上游基因/蛋白的表达一致性分析,从而解析代谢物编码基因/蛋白对下游代谢物的影响; (2)转录/蛋白和代谢物的表达相关性分析,从而揭示mRNA和代谢物在表达水平上的相关性,从而反应其在生物学过程或疾病进程中发挥的协同或者抑制作用; (3)分析不同作用因子...
我们分别评估了疾病、年龄和性别对转录组、蛋白质组和代谢组表达的影响。选取前1000个基因、代谢物和所有蛋白质进行主成分分析。结果显示,疾病状态和年龄是导致转录组、蛋白质组和代谢组变化的主要因素(图2A-F)。显然,CHD-PBS综合征患者、CHD-NPBS综合征患者和健康成人在mrna、蛋白质和代谢物的表达上存在显著差异。...
蛋白质组学和代谢组学结果表明,PAAD中多种代谢过程被异常调控,这种失调与TAM2浸润水平有关。WGCNA证实了丙酮酸和糖酵解/糖异生是TAM2在PAAD中共同表达的代谢途径。基于转录组数据,作者将PAAD样本分为4种与TAM2相关的代谢亚型。代谢亚型各具有临床预后、肿瘤微环境、免疫细胞浸润、化疗药物敏感性和功能机制等特征。
本研究使用亚硒酸盐和硒酸盐处理茶树后进行了转录组和蛋白质组测序和分析,获得了差异表达基因和差异表达蛋白。GO分析结果表明,Na2SeO3处理后,氨基酸和蛋白代谢、还原反应强烈上调。KEGG分析结果表明,参与氨基酸和谷胱甘肽代谢的基因上调,参与...
5、WGCNA分析鉴定相关基因和蛋白质网 6、转录组和蛋白组联合分析 7、qRT-PCR验证 实验路线 研究内容 1 油茶发育期生理变化 测定了果实和种子在四个发育时期的表型特征和储备积累的动态变化(图1)。 图1 油茶种子的发育。油茶种子四个生长时期的表型特征。S1,营养合成阶段;S2,脂肪堆积阶段;S3,成熟阶段;而S4,后期...
最新研究通过大规模的蛋白转录组,及代谢组学的联合分析,揭示了长新冠症状的发生和持续背后的免疫机制,并找到诊断生物标志物和潜在治疗靶点。为长新冠的临床诊治新思路提供基础。张文宏团队自2022年启动研究,通过对21826名首次感染新冠的患者的流行病学及临床特征分析,发现近9%的患者在感染后6个月报告了长新冠症状,其中...