结果解释:通过一个简单的流程将同一个单细胞的RNA-seq和ATAC-seq的数据相整合,获得转录图谱和染色质景观的一体化视图。以单细胞核悬液作为起始样本,对大量细胞核进行转座酶切割,之后将单个细胞核捕获在GEM(Gel Bead-in-emulsion)中,其中DNA片段和mRNA的3端都带有条形码,每个样本生成两个互补文库(基因表达文库和ATAC...
ATAC-seq(Assay for Transposase-Accessible Chromatin with high throughput sequencing)是通过使用高通量测序对转座酶可接近性核染色质区域进行分析的一种创新表观遗传学研究技术。该技术通过转座酶对某种特定时空下开放的核染色质区域进行切割,进而获得在该特定时空下基因组中所有活跃转录的调控序列。 真核生物的DNA并不...