这些种子蛋白被选择形成与感兴趣的目标位点互补的区域的基础,随后使用计算设计将其纳入更大的蛋白质单元,这代表了新型蛋白-蛋白间相互作用(PPI)计算设计的新范式。 为了验证这种方法的实际效果,研究团队选择了4种重要的蛋白质作为靶点,分别是SARS-CoV-2病毒的刺突蛋白(S蛋白),以及三种重要的用于癌症免疫治疗的免疫检查...
作者基于这个transformer开发了PeSTo,一种蛋白质结合界面预测器。PeSTo被训练用于预测蛋白质-蛋白质相互作用界面,性能超过了目前的模型。由于该方法不依赖于任何显式的物理化学特征参数化,因此训练以预测其他类型的结合界面是很容易的。 模型(PeSTo) PeSTo,一种无需参数的几何transformer,直接作用于蛋白质的原子上。如上...
蛋白结合protein binding,是指进入血液循环的药物与血浆蛋白的结合。 基本信息 中文名称 蛋白结合 外文名称 protein binding 相关 血液循环 类型 名词 定义 与药物结合的蛋白质以白蛋白为主,也有少量α和β球蛋白。各360百科药的蛋白结合率差异极大,如双香盾豆素类的华法林结合率可高达99%,而异烟肼和卡那霉素等则...
ASO的血浆蛋白结合会极大地影响其系统清除,尤其是肾脏清除[5],而与细胞表面蛋白的结合可以调节ASO的细胞摄取能力。另一方面,与组织细胞内的蛋白结合也对ASO的组织半衰期有较大影响。 ASO的亲水性和序列特征可以影响它的蛋白结合程度及结合速度。低蛋白结合的ASO,其细胞摄取能力也比较低,且肾清除率较高。例如,吗啉环...
单纯蛋白质是指分子组成中，除氨基酸构成的多肽蛋白成分外，没有任何非蛋白成分称为单纯蛋白质。自然界中的许多蛋白质属于此类。而结合蛋白质是单纯蛋白质和其他化合物结合构成，被结合的其他化合物通常称为结合蛋白质的非蛋白部分(辅基)。按其非蛋白部分的不同而分为核蛋白(含核酸)、糖蛋白(含多糖)、脂蛋白(含...
本发明进一步提供了利用白蛋白-结合蛋白作为疗法,利用SPARC和SPARC的抗体或SPARC结合-蛋白作为疗法,用于将化疗剂递送至哺乳动物疾病部位的方法,其中该方法包括给予哺乳动物治疗有效量的药物组合物,其中该药物组合物包含与能结合白蛋白-结合蛋白的化合物偶联的化疗剂和药学可接受载体。此外,本发明提供了包含与能结合SPARC...
他表示：“该研究得出的实验结果和数学模型，挑战了一直以来教科书所描述的蛋白在基因调控过程中, 精确寻找并结合在基因组特定区域的机制。尽管 DNA 序列是蛋白搜索和蛋白结合的决定性因素，但并非因为特定序列而导致蛋白单次紧密结合的时间更长、以及脱离速度更缓慢，而是因为特定序列更容易被再次结合。”1 月 27 日...
1、第三章 药物的蛋白结合药物的蛋白结合Drug-Protein Binding一、概述一、概述 含义:血液通常分为红细胞和血浆两部分 狭义的概念:血浆中含有68的蛋白质,其构成如下:清(白)蛋白(分子量最小,69000 。占血浆总蛋白量的5060,药物蛋白结合以此为主 ) ,球蛋白 ,纤维蛋白元 , 酸性糖蛋白 ,脂蛋白 广义的概念:药物...
*测试数据集。包含150个从PDB和福泰内部数据中收集的复合物结构，挑选的标准是配体小分子是类药的（drug-like），其中有一些是上市药物。蛋白包含63种，其中有85个复合物结构中的蛋白是激酶和蛋白酶。*应变能。应变能的计算是通过OPLS-AA和MMFF两种力场，在真空和连续溶剂两种条件下，配体的结合构象与全局最优构象...