4、构建进化树 在主界面点击PHYLOGENY(树状图标)➡选第二个NJ邻接法建树 *最大似然法 (Maximum Likelihood) 和邻接法 (Neighbor-Joining) 是两种常见的建树方法两种方法之间的主要区别在于,最大似然法需要计算所有可能的树形状,因此对于大型数据集来说计算量很大,并且可能会受到计算资源的限制。而邻接法则是一种启发...
基因进化树的构建和美化(中) 【多序列比对与MEGA构建进化树】 1330 -- 1:22 App MEGA 11 构建进化树工具 安装包下载安装超简单,电脑小白也会 1194 1 11:56 App NEGA11构建系统进化树(全套流程) 2.5万 8 10:57 App MEGA11构建及美化系统发育树 1089 1 1:26 App MEGA11进化树构建 1425 2 10:39...
上一期已经给大家介绍根据基因或者蛋白ID在NCBI上进行BLAST并下载FASTA序列,然后将序列导入MEGA软件中进行比对,最后生成.meg的序列比对文件。 那么用这个文件是不是就能构建进化树呢,当然可以。方法也很简单,单击菜单【File】→【Open A File/Session】,打开上述.meg文件,点击工具栏中的【PHYLOGENY】→【Construct/Test ...
基因进化树的构建和美化(中) 【多序列比对与MEGA构建进化树】 2442 -- 2:14 App mega构建系统进化树 1.2万 -- 1:11 App mega软件 比例尺 标尺 scale设置 2948 -- 1:53 App 如何使用Mega软件绘制遗传距离进化树(聚类分析) 4429 -- 1:44 App 用MEGA-X软件构建系统进化树 5170 5 17:05 App 如...
通过进化树我们可以揭示生物进化历史、推断分类学关系、预测生物学特征等,在生物学中很常用,今天小果来分享一下用MEGA构建进化树的方法。 构建进化树的过程可以分为三个主要步骤:收集序列数据、进行多序列比对、利用比对结果建立进化树。以下是基于MEGA11.0.13软件的详细步骤: ...
MEGA 是一个关于序列分析以及比较统计的工具包,其中包括有距离建树法和 MP 建树法;可自动或手动进行序列比对,推断进化树,估算分子进化率,进行进化假设测验,还能联机的 Web 数据库检索。下载后可直接使用,主要包括几个方面的功能软件:i)DNA 和蛋白质序列数据的分析软件。ii)序列数据转变成距离数据后,对距离数据分析...
MEGA 是一个关于序列分析以及比较统计的工具包,其中包括有距离建树法和 MP 建树法;可自动或手动进行序列比对,推断进化树,估算分子进化率,进行进化假设测验,还能联机的 Web 数据库检索。下载后可直接使用,主要包括几个方面的功能软件:i)DNA 和蛋白质序列数据的分析软件。ii)序列数据转变成距离数据后,对距离数据分析...
如何用MEGA构建进化树 是一个关于序列分析以及比较统计的工具包,其中包括有距离建树法和MP建树法;可自动或手动进行序列比对,推断进化树,估算分子进化率,进行进化假设测验,还能联机的Web数据库检索;下载后可直接使用,主要包括几个方面的功能软件:iDNA和蛋白质序列数据的分析软件;ii序列数据转变成距离数据后,对距离数据...
第一步：搜集尽可能多的目标基因序列，包括核苷酸序列或氨基酸序列，理想的结果应包含15-20个物种，最初可以搜集30个序列作为备选。第二步：从数据库下载的FASTA格式的序列保存在一个txt文件中。第三步：将txt文件的后缀名改为fas。（建议复制一个副本，便于后续建树时删除不可用的序列。）第四步：在...
1、.如何用MEGA构建进化树MEGA3.1是一个关于序列分析以及比较统计的工具包,其中包括有距离建树法和MP建树法;可自动或手动进行序列比对,推断进化树,估算分子进化率,进行进化假设测验,还能联机的Web数据库检索。下载后可直接使用,主要包括几个方面的功能软件:i)DNA和蛋白质序列数据的分析软件。ii)序列数据转变成距离...