比起基于序列的转录因子预测,这种基于ChIP实验的seq数据,在最后的实验验证中,阳性率会更高,提示作用也更强。但是,大数据毕竟是大数据,依然不能直接明确分子间的真实互作关系。想发高分文章,记得一定要补充ChIP实验验证哦! 查看原文:生信实操丨用ChIP-seq公共数据探索组蛋白表观遗传修饰参与目标基因的调控情况 注:此...
这个数据库重点收录的是人类和小鼠的ChIP-seq数据,物种根据大家的研究需求选择即可。HepG2是人源细胞系,因此这里物种选择Homo,点选后样本来源框会发生相应改变。我们在其中找到HepG2,点选后就能在最后一项Factors选项中,查看数据库中包含的H3表观遗传修饰形式啦。我在其中翻看了一下这里包括乙酰化修饰形式的类型,有H...