生信分析(bioinformatics analysis)是运用新的高通量分子生物技术收集并分析大量组学数据, 进而在数据研究基础上对生物医学问题进行研究、开发。生信分析可以认为是生物信息学的重要组成部分之一。 生物信息学的英文单词由生物、信息、组学三个单词组成,其内在含义又有广义和狭义之分: 广义的生信分析: 应用信息科学的方法和技术
结合领域知识和统计分析方法,更准确地解读生信图并得出有意义的结论,让数据不再成为你的困惑,根据具体的数据和研究问题来解读生信图,戳破那层神秘的面纱~快来跟我们一起探险吧! 01、火山图和维恩图 火山图(Volcano plot)是一种常用于高通量基因表达数据分析的可视化图表类型,它能够直观地展示差异表达基因的数量和程...
至此这篇文章的分析就结束了,分析的前三步就是常规的生信加免疫套路,先分析免疫相关评分与临床病理特征间的联系,随后筛选差异表达基因,进行功能富集并构建PPI网络。 其实仅仅这三步的分析也可以组合成一篇稍微低阶的SCI文章了,从第四步开始筛选出枢纽基因进行预后分析、COX分析、构建模型、绘制ROC曲线、免疫浸润相关性...
2.转录组学分析:研究基因的表达情况,包括mRNA的表达水平。 3.蛋白质组学分析:研究蛋白质的表达和结构,以及它们在细胞过程中的功能。 4.元组学分析:综合分析多种生物学数据,例如基因组、转录组和蛋白质组,以全面理解生物系统。 5.分子进化分析:研究基因和蛋白质在不同物种之间的演化关系。 二、生信分析应用 1....
生信分析是指对生物信息进行的分析和处理过程。生物信息是反映生物状态和方式的信息,如遗传密码等。背景:自然界经过漫长时期的演变,产生了生物,并逐渐形成了复杂的生物世界。这些生物体内蕴含着大量的生物信息,生信分析便是为了揭示和利用这些信息。专业人员:生物信息分析师是从事生信分析的专业人员,他们...
本吧热帖: 1-单细胞hdWGCNA共表达单细胞人工注释 bulk数据验证 2-最新生信自学 SCI狂人 丁香园和其他科研大课,便宜买,回回本 3-中性粒细胞诱捕网文章套路ETs/WGCNA共表达/样品分型) 4-生物数据存储现状调研:助力科研高效管理 5-生信分析需要的联系 6-生信工作组,生信
【生物信息学入门的6个基础分析】 (1)数据下载及预处理 (2)筛选疾病相关的差异表达分子 (3)基因注释与功能分类 (4)构建分子互作网络 (5)从差异表达分子中筛选关键基因 (6)分析关键基因与临床特征/预后的关联 以上是最基础也是最简单的生信分析,刚接触生信分析的小伙伴可以从这几个分析入手。为了让大家更直观了...
近年来,Meta分析、生信分析、临床研究这几种不需要实验,运用他人的数据就可以发文章的研究方法可谓是大热门。生信分析作为其中一种方法,主要是指利用生物信息学工具、方法和技术对生命科学数据进行分析和研究的一个领域。它主要应用于分子生物学领域,是对大量生物信息数据进行有效处理、挖掘和分析的重要手段 生信分析...
公众号:生信小课堂 影响因子:7.3 研究概述: 炎症性肠病(IBD)是一种影响胃肠道的慢性、复发性炎症,主要涉及溃疡性结肠炎和克罗恩病。其最常见的症状包括便血、腹泻和胃痛。IBD主要由遗传易感性、肠道菌群失调和黏膜免疫反应异常引起,但其确切原因尚不清楚。系统性红斑狼疮(SLE)是一种多器官慢性自身免疫性疾病...
生信分析中,有一种算法叫反卷积分析,英文名叫Deconvolution。生信开发人员可以先通过预设一个优秀的数据训练集(训练集主要包含了每种不同免疫细胞的基因表达特征),然后通过反卷积算法推算出这个整体样本中究竟有哪些免疫细胞。目前已公开发表的在线数据库中,包括TIMER、CIBERSORT、ImmuneCellAI、ABIS、EPIC等,通过机器学习...