生信分析(bioinformatics analysis)是运用新的高通量分子生物技术收集并分析大量组学数据, 进而在数据研究基础上对生物医学问题进行研究、开发。生信分析可以认为是生物信息学的重要组成部分之一。 生物信息学的英文单词由生物、信息、组学三个单词组成,其内在含义又有广义和狭义之分: 广义的生信分析: 应用信息科学的方法和...
结合领域知识和统计分析方法,更准确地解读生信图并得出有意义的结论,让数据不再成为你的困惑,根据具体的数据和研究问题来解读生信图,戳破那层神秘的面纱~快来跟我们一起探险吧! 01、火山图和维恩图 火山图(Volcano plot)是一种常用于高通量基因表达数据分析的可视化图表类型,它能够直观地展示差异表达基因的数量和程...
2.转录组学分析:研究基因的表达情况,包括mRNA的表达水平。 3.蛋白质组学分析:研究蛋白质的表达和结构,以及它们在细胞过程中的功能。 4.元组学分析:综合分析多种生物学数据,例如基因组、转录组和蛋白质组,以全面理解生物系统。 5.分子进化分析:研究基因和蛋白质在不同物种之间的演化关系。 二、生信分析应用 1....
"生信分析" 是"生物信息学分析"(Bioinformatics Analysis)的简称。这是一个交叉学科领域,主要关注使用计算机科学、数学和统计学方法来解析生物数据,特别是与分子生物学相关的数据。在近年来,随着高通量测序技术(如 RNA-seq、ChIP-seq、Whole Genome Sequencing 等)的迅猛发展,生物信息学在生物医学研究、药物发现、精准...
生信分析 是指生物信息分析、方法和技术对生命科学数据进行分析和研究的一个领域。它主要应用于分子生物学领域，是对大量生物信息数据进行有效处理、挖掘和分析的重要手段。生信分析主要包括两大类：一类是对DNA、RNA、蛋白质和代谢物进行定量和定性分析；另一类是对复杂的生物信息数据进行图形化展示、可视化分析以及机器...
在线工具一般具有“操作简单、无需安装、用完就走”的特点,轻松实现用别人的服务器分析自己的数据。下面就为大家分享17个实用的小工具,感兴趣的小伙伴可以试试呀! 1. GO、KEGG富集分析工具 OmicShare的GO、KEGG富集分析工具非常强大,只需上传目的基因文件,即可进行常见物种的GO、KEGG富集分析。分析结果中,直接包含数据...
之前发了很多篇关于机器学习挖掘关键基因的,今天换换口味纯生信,基本上常用的生信方法全都在这篇文章里了。 up今天带来的这篇文章干货满满,生信综合分析去挖掘关键的基因,挺暴力的就是硬干,用了9个数据集算是比较多的了,整篇文章对数据的挖掘是相当充分,但是方法都是大家熟知的(ps:要活用这些分析方法,原理一定要...
生信分析之多变量分析 PCA分析 PCA全称为主成分分析法(Principal Component Analysis),是一种无监督的降维算法[1]。主要思想是从原始的高维空间中顺序地找一组相互正交的坐标轴,新的坐标轴的选择与数据本身是密切相关的。新坐标轴方向就是原数据协方差矩阵特征...
MACS2是目前最常用的用来检测ChIP-seq 峰的软件,无论是转录因子还是各种组蛋白修饰,具体的操作可参考之前的推送“生信分析:NG-拟南芥雄配子发生-ChIP-seq数据分析”。其实该软件自带了差异peak分析功能。 MACS2软件bdgdiff选项可以用来检测一个样本对另一个样本的差异peak,注意一定是一个,即不支持生物学重复。
📊生信分析,全称生物信息学分析,是一种研究生物数据的方法。它包含以下九大步骤:1️⃣ 数据收集📚:从各种渠道获取基因测序数据、蛋白质组数据等生物数据。2️⃣ 数据预处理🧼:对数据进行清洗、过滤,确保数据的准确性和可靠性。3️⃣ 数据标准化📏:使不同来源的数据具有可比性,便于后续分析。4...