1. NCBI数据库:美国国家生物技术信息中心(NCBI)提供了包括GenBank、PubMed、BLAST等多种数据库和工具。GenBank是一个核酸序列数据库,PubMed则是一个生物医学文献数据库,而BLAST是一种用于序列比对的工具。 2. ENSEMBL:专注于脊椎动物和其他模式生物的基因组注释,提供详细的基因结构、变异和基因表达数据。 3. UCSC ...
GSCA(Gene Set Cancer Analysis)是一个涵盖单基因分析、多基因分析、免疫浸润分析、突变分析以及药物敏感性分析的交叉式综合性癌症分析数据库,其中包含了涵盖了来自TCGA和GDSC的33种不同类型的癌症数据。除此之外,该网站还将基因数据与临床信息和750多种小分子药物密切结合,这为挖掘候选生物标志物和有潜在价值的小分子...
由美国NIH(National Institutes of Health)构建的目前最多人使用的整合型生物信息数据库,查找数据和文献必备。 - NCBI数据库主要包括DNA序列数据库GeneBank,生物医学文献书目数据库PubMed,人类单基因遗传病数据库OMIM,物种分类Taxonomy Browser,3D结构Structure,基因注释数据库GEO,蛋白质序列数据库RefSeq,dbSNP,dbEST等。 -...
生信分析数据库 最强生信数据库合集 生信风暴 · 64 篇内容 DGIdb:药物基因相互作用数据库 DGIdb数据库(Drug-Gene Interaction database),是一个药物-基因相互作用数据库,提供了基因与其已知或潜在药物关联信息,目前已经更新到4.0版本。里面的基因主要是癌基因,但是也有一些其他疾病(例如阿尔兹海默病、心脏病、糖尿病...
【原创】生信分析常用基因组数据库汇总 一、综合性基因组数据库 1、NCBI Assembly 目前最常用的综合性基因组数据库,没有之一(毕竟 NCBI ~) 网址:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/assembly/ 2、CNGB 中国国家基因库生命大数据平台 网址:https://db.cngb.org/ ...
GSCA(Gene Set Cancer Analysis)是一个涵盖单基因分析、多基因分析、免疫浸润分析、突变分析以及药物敏感性分析的交叉式综合性癌症分析数据库,其中包含了涵盖了来自TCGA和GDSC的33种不同类型的癌症数据。除此之外,该网站还将基因数据与临床信息和750多种小分子药物密切结合,这为挖掘候选生物标志物和有潜在价值的小分子...
生信分析数据库主要包括以下几种: 1. NCBI的Gene数据库:提供了关于基因的全面信息,包括基因定位、基因产物、参考文献等。 2. UniProt数据库:一个全面的、高质量的蛋白质序列和功能信息的数据库。 3. Ensembl数据库:提供了基因组浏览、注释和变异信息。 4. KEGG数据库:主要用于基因功能、基因组信息、生物通路等...
GSCA(Gene Set Cancer Analysis)是一个涵盖单基因分析、多基因分析、免疫浸润分析、突变分析以及药物敏感性分析的交叉式综合性癌症分析数据库,其中包含了涵盖了来自TCGA和GDSC的33种不同类型的癌症数据。除此之外,该网站还将基因数据与临床信息和750多种小分子药物密切结合,这为挖掘候选生物标志物和有潜在价值的小分子...
生信分析可以让我们做到“拿别人的数据,发自己的SCI”!但前提是,咱得先学会熟练使用各大生信数据库! 而大部分生信数据库,操作不统一,代码不能复用,甚至有的连网页也打不开,更麻烦的是有的小伙伴连每个数据库是做啥的都搞不清。 为帮助大家学会挖掘各个数据库,做到“无中生有”发文章,我们整理出1000+页独家生...
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