ATAC-seq出来的结果,和传统方法出来的结果具有很强的一致性,同时也和基于组蛋白修饰marker的ChIP-seq有较高的吻合程度。也就是说,ATAC-seq中的peak,往往是启动子、增强子序列,以及一些反式调控因子结合的位点。 相比起来,ATAC-seq的重复性,比MNase-seq和DNase-seq的更强,操作起来也更加简单,而且只需要很少的...
ATAC-seq出来的结果,和传统方法出来的结果具有很强的一致性,同时也和基于组蛋白修饰marker的ChIP-seq有较高的吻合程度。也就是说,ATAC-seq中的peak,往往是启动子、增强子序列,以及一些反式调控因子结合的位点。 相比起来,ATAC-seq的重复性,比MNase-seq和DNase-seq的更强,操作起来也更加简单,而且只需要很少的...
ATAC-seq出来的结果,和传统方法出来的结果具有很强的一致性,同时也和基于组蛋白修饰marker的ChIP-seq有较高的吻合程度。也就是说,ATAC-seq中的peak,往往是启动子、增强子序列,以及一些反式调控因子结合的位点。 相比起来,ATAC-seq的重复性,比MNase-seq和DNase-seq的更强,操作起来也更加简单,而且只需要很少的细胞/...
ATAC-seq，全称为Assay for Transposase Accessible Chromatin with high-throughput sequencing，是一种利用转座酶研究染色质可进入性的高效测序技术，旨在揭示染色质开放区域的结构和功能。染色体由DNA和组蛋白组成，通过复杂的折叠机制压缩至细胞核内。开放染色质是指DNA在表达基因时，其结构允许转录因子等调控...
ATAC-seq全称Assay for Transposase Accessible Chromatin with high-throughput sequencing,即利用转座酶研究染色质可进入性的高通量测序技术。 DNA转座,是一种把DNA序列从染色体的一个区域搬运到另外一个区域的现象,由DNA转座酶来实现。这种转座插入DNA,也是需要插入位点的染色质是开放的,否则就会被一大坨高级结构给卡住...
ATAC-seq通过标记转座酶Tn5插入开放染色质，通过PCR测序确定开放区域，结果与传统方法和ChIP-seq有良好一致性，主要检测启动子、增强子和调控因子结合位点。ATAC-seq具有高重复性、操作简便、样本需求量少、信号清晰等优点，已成为研究染色质开放性的重要工具。相比MNase-seq和DNase-seq，ATAC-seq成为了研究...
通过ATAC-seq 技术我们可以获得在该特定时空下细胞基因组中所有的处于松散状态的核酸序列,真核细胞通过将基因组 DNA 与组蛋白进行不同层次的折叠组装成染色质,这些精密组装信息在基因转录调控中起决定性作用。染色质区域的可接近性是特异性反式作用因子和顺式调控元件相互作用的前提。结合 ATAC-seq 技术与 RNA-seq ...
染色质分为常染色质和异染色质,而常染色质处于松散的开放状态,允许反式作用因子结合顺式调控元件,进而调控基因表达。 ATAC-seq利用Tn5酶切割并捕获染色质开放区域,结合高通量测序和生信分析,可以系统研究全基因组范围内染色质开放区域, 是表观调控研究的新方向。
ATAC-seq全称Assay for Transposase Accessible Chromatin with high-throughput sequencing，即利用转座酶研究染色质可进入性的高通量测序技术。要理解这项技术的作用，首先需要认识染色体的结构。真核生物的核DNA并不是裸露的，而是有蛋白质即组蛋白与之相结合的。DNA一圈一圈地缠绕在组蛋白上，形成串珠式...
ATAC-seq 只需要很少的细胞就能鉴定基因组中所有活跃的调控序列。在 ATAC-seq 技术中,DNA 探针(作为转座子发挥作用)通过酶促反应(转座酶 Tn5)被整合到基因组的开放区域,然后通过测序来鉴定这些区域。 技术应用 通过ATAC-seq 技术我们可以获得在该特定时空下细胞基因组中所有的处于松散状态的核酸序列,真核细胞通过...