基于小鼠15个组织RNA-seq数据的全基因组重注释 一、研究背景 近年来,RNA-seq技术在分子生物学中得到广泛应用。通过RNA-seq技术可以快速获得高通量的转录组数据,对基因功能以及转录调节进行研究,有助于深入了解生物的基本生理和病理过程。在进行RNA-seq实验时,进行正确的注释是基础,它能够影响到结果的准确性和可靠性。
请注意,两个数据集中的细胞类型比例应该相似:例如,如果Meis在 snRNA-seq 中是一种罕见的细胞类型,那么即使在空间数据中,它也应该是一种罕见的细胞类型。 ad_sc.obs.subclass_label.value_counts() 5 准备映射 Tangram 学习单细胞数据的空间对齐,以便对齐的单细胞数据的基因表达与空间数据的基因表达尽可能相似。
拟基于小鼠15个重要组织(大肠,小肠,胃,睾丸及脑等)的RNA-seq数据对小鼠进行全基因组的重注释,主要包括原注释基因的修订,非编码基因的鉴定以及House-keeping基因和... 曾瀞瑶 - 《中国科学院北京基因组研究所》 被引量: 0发表: 2015年 一种针对RNA-Seq数据的基因异构体表达水平计算方法 RNA-Seq是基于高通量测...