例如,在肠道微生物群落与宿主代谢之间的研究中,发现了微生物对宿主代谢的影响,以及宿主代谢对微生物群落的调控作用。这些研究结果为疾病的预防和治疗提供了新的思路和方法。 宏基因组联合代谢组学是一种综合利用宏基因组和代谢组学技术的研究方法,通过对宿主与微生物相互作用的分析,可以揭示其在健康和疾病状态下的...
细菌宏基因组学是一种研究环境中微生物群落基因组的方法。它通过对环境样本中的所有DNA进行高通量测序,以了解其中存在的微生物种类、丰度和功能。细菌宏基因组学可以帮助我们了解微生物群落如何相互作用以及它们在生态系统中扮演的角色。 代谢组学是一种研究生物体内代谢产物的方法。它通过分析生物体内的小分子代谢产物,...
而肠道代谢物如氨基酸和细菌代谢物(如胆汁酸和短链脂肪酸),也与肠道癌变相关。因此,联合宏基因组学和代谢组学对肠道环境相关变化进行关联分析可诠释CRC发展过程。日本东京工业大学Takuji Yamada科研团队对来大队列CRC样本进行了粪便宏基因组和代谢组学研究,获得不同阶段CRC特异性表型的微生物和代谢标志物,相关成果发表...
宏基因组学可以用于研究环境中的微生物群落结构、功能和进化特征。通过对环境样本进行宏基因组测序和分析,可以了解环境中细菌的多样性、丰度和分布情况,为环境保护和生态修复提供科学依据。 二、细菌代谢组学 1.代谢产物的提取与分离 代谢组学主要研究细胞内小分子代谢物的种类、含量及其变化规律。首先需要对细菌样本进...
宏基因组学可以研究系统发生的多样性,提供了肠道微生物潜在功能的库存,究因肠道微生物群落结构的改变引起的肠道疾病或其他疾病。 代谢组学代谢组是一个细胞或组织的生物化学表现型,代谢组的成分即代谢产物是基因表达的最终产物,在代谢酶的作用下生成。细胞内许多生命活动实际上是发生在代谢物层面的,如细胞信号释放、能...
该研究调查了 76 例类风湿性关节炎(RA)患者(四个阶段)的粪便宏基因组和血浆代谢组特征,并在271 名患者的验证队列中进行验证。结果表明,微生物代谢失调和代谢紊乱呈现出不同的模式,并发挥阶段特异性的作用,临床微生物干预应考虑RA阶段...
宏基因组研究包括16s测序和宏基因组测序,可以获得微生物群落丰度以及组成。通过分析可以获得关键菌群以及功能,为疾病治疗提供研究基础。代谢组学是基于LC-MS/MS液质联用技术对生物样本中的小分子代谢物进行定性和相对定量分析。宏基因组-代谢组的联合分析能够...
虽然已有研究发现添加剂的使用影响青贮饲料中细菌群落的组成和相对丰度，但对青贮中的抗性基因和代谢物的影响研究较少。百趣代谢组学解读。本研究基于LC-MS非靶代谢组学和宏基因组技术平台，对四种不同处理的高水分玉米粒青贮（去离子水CK、香兰素V、植物乳杆菌LP和短乳杆菌LB，n = 6/组)进行研究，并发现不同...
采用宏基因组和代谢组联合分析,检测结肠直肠癌不同阶段的粪便样本,揭示结肠直肠癌中肠道菌群的阶段特异性表型,为 CRC 发展阶段的诊断提供方法。 方法流程 研究结果 1.粪便样本中宏基因组和代谢组学特征 为研究 CRC 中宏基因组和代谢组的特征,根据结肠镜和组织学检查结果分为9组,图1分别对616例宏基因组数据和406...
粪便宏基因组的变化与血清代谢物相关 接下来,作者想了解哪些环境因素影响了肠道微生物组改变的水平。众所周知,血清代谢物在介导微生物组与其宿主之间的代谢和免疫相互作用中起着关键作用,从而为环境暴露的复杂动态提供了基本视图。与肠道微生物组一致,AR 个体表现出明显血清代谢物水平的变化。作者在三组中鉴定出52种改...