因此,联合宏基因组学和代谢组学对肠道环境相关变化进行关联分析可诠释CRC发展过程。日本东京工业大学Takuji Yamada科研团队对来大队列CRC样本进行了粪便宏基因组和代谢组学研究,获得不同阶段CRC特异性表型的微生物和代谢标志物,相关成果发表于《Nature Medicine》。 粪便宏基因组学和代谢组学分析 根据肠镜和组织学检查结...
4、RA阶段特异的代谢组学特征 进一步运用代谢组学数据分析,对232个微生物组物种、6224个KO和277个代谢物进行随机森林分析,以测试它们对RA和OA每个阶段的诊断潜力(图3A-E)。受试者工作特征曲线下面积0.974~0.998。物种和KO水平上的其他...
(A)使用分级聚类模型表示样本的代谢轮廓(B)使用主成分分析模型表示样品的代谢轮廓。 2 基于群落结构预测代谢活动的区域性差异 DNA测序结果和代谢组学分析结果均说明了不同区域轮廓的发展变化,尽管TC和DC区域存在明显的相似性。为对群落结构与所产生的代谢物进行比较,开展了Mantel检验和Procrustes统计分析。Mantel检验结果...
百迈客微生物产品部具有多年宏基因组研究经验,针对不同类型的样本均具有丰富的实验经验,对于提取困难样本还研发了微量建库技术("无偏差 " 宏基因组微量建库:难提取样本的福音),此外宏基因组APP还提供40余项免费个性化分析内容,同时与代谢组多组学联合分析全新升级,包含普氏分析、相关性分析、随机森林等多项内容,为您...
组学技术:非靶向代谢组学、16s rRNA检测、宏基因组检测 样本类型:胎儿粪便 研 究 背 景 胎儿生长受限(FGR)一般是指患有各种母体、胎儿和胎盘疾病的个体的生长潜力受限。胎儿生长受限的发生率高达10%,是婴儿发病率和死亡率的主要原因...
于今日再次推出菌群多样性与代谢组联合云分析系统以及宏基因组与代谢组联合云分析系统,这两款联合分析系统将更准确地将微生物群落或特定基因或基因簇与代谢产物的变化关联起来,揭示微生物群落或基因表达调控与代谢途径活动之间的直接或间接联系,为解析环境体系中基因功能、微生物群落结构与其代谢产物之间的复杂相互作用提供...
粪便宏基因组是定量肠道菌群和诊断疾病强有力的工具,特别是具核梭杆菌(F. nucleatum)与 CRC 的相关性机制已经阐明,肠道代谢物(氨基酸、胆汁酸、短链脂肪酸)与肠道癌变相关。因此,通过宏基因组和代谢组联合分析,试图找到一种通过肠道代谢物与菌群结构的变化规律,对 CRC 不同发展阶段进行诊断的方法。
宏基因组,代谢组。 【实验路线】 【研究结果】 LO-CRC和EO-CRC之间的微生物组差异 根据实验设计(图1A),作者首先进行了发现队列的微生物组分析,结果表明,与同年龄段的对照相比,CRC组的α多样性显著降低(图1B),且细菌分布上有显著差异(图1C-D)。
宏基因组,代谢组。 【实验路线】 【研究结果】 LO-CRC和EO-CRC之间的微生物组差异 根据实验设计(图1A),作者首先进行了发现队列的微生物组分析,结果表明,与同年龄段的对照相比,CRC组的α多样性显著降低(图1B),且细菌分布上有显著差异(图1C-D)。
宏基因组,代谢组。 【实验路线】 【研究结果】 LO-CRC和EO-CRC之间的微生物组差异 根据实验设计(图1A),作者首先进行了发现队列的微生物组分析,结果表明,与同年龄段的对照相比,CRC组的α多样性显著降低(图1B),且细菌分布上有显著差异(图1C-D)。