细菌宏基因组学是一种研究环境中微生物群落基因组的方法。它通过对环境样本中的所有DNA进行高通量测序,以了解其中存在的微生物种类、丰度和功能。细菌宏基因组学可以帮助我们了解微生物群落如何相互作用以及它们在生态系统中扮演的角色。 代谢组学是一种研究生物体内代谢产物的方法。它通过分析生物体内的小分子代谢产物,以了解生物体内的代
例如,在肠道微生物群落与宿主代谢之间的研究中,发现了微生物对宿主代谢的影响,以及宿主代谢对微生物群落的调控作用。这些研究结果为疾病的预防和治疗提供了新的思路和方法。 宏基因组联合代谢组学是一种综合利用宏基因组和代谢组学技术的研究方法,通过对宿主与微生物相互作用的分析,可以揭示其在健康和疾病状态下的...
糖是咖啡发酵的主要代谢物,主要被微生物利用。微生物激活有助于果胶糖产生乙醇、乳酸、乙酸、丁酸和其他羧酸。 在蜜处理法中,微生物活跃直到咖啡豆的水分活度低于0.6。 基于宏基因组学过程提取总 DNA 靶向,对细菌和真菌微生物群进行分子分析。我们获得了蜜处理咖啡豆的 11 个样品的测序,并确定了每个样品的属富集(...
而肠道代谢物如氨基酸和细菌代谢物(如胆汁酸和短链脂肪酸),也与肠道癌变相关。因此,联合宏基因组学和代谢组学对肠道环境相关变化进行关联分析可诠释CRC发展过程。日本东京工业大学Takuji Yamada科研团队对来大队列CRC样本进行了粪便宏基因组和代谢组学研究,获得不同阶段CRC特异性表型的微生物和代谢标志物,相关成果发表...
组学技术:非靶向代谢组学、16s rRNA检测、宏基因组检测 样本类型:胎儿粪便 研 究 背 景 胎儿生长受限(FGR)一般是指患有各种母体、胎儿和胎盘疾病的个体的生长潜力受限。胎儿生长受限的发生率高达10%,是婴儿发病率和死亡率的主要原因...
开展宏基因组学可解析土壤微生物的功能 。土壤代谢组学可分析不同季节土壤代谢物变化 。宏基因组学能对比不同地域土壤微生物基因差异 。土壤代谢组学可助力寻找土壤污染的生物标志物 。宏基因组学可挖掘土壤中抗生素抗性基因 。土壤代谢组学研究需对样品进行预处理 。宏基因组学实验要保证DNA提取的质量 。土壤代谢组...
宏基因组学可以用于研究环境中的微生物群落结构、功能和进化特征。通过对环境样本进行宏基因组测序和分析,可以了解环境中细菌的多样性、丰度和分布情况,为环境保护和生态修复提供科学依据。 二、细菌代谢组学 1.代谢产物的提取与分离 代谢组学主要研究细胞内小分子代谢物的种类、含量及其变化规律。首先需要对细菌样本进...
宏基因组学可以研究系统发生的多样性,提供了肠道微生物潜在功能的库存,究因肠道微生物群落结构的改变引起的肠道疾病或其他疾病。 代谢组学代谢组是一个细胞或组织的生物化学表现型,代谢组的成分即代谢产物是基因表达的最终产物,在代谢酶的作用下生成。细胞内许多生命活动实际上是发生在代谢物层面的,如细胞信号释放、能...
本研究基于LC-MS非靶代谢组学和宏基因组技术平台,对四种不同处理的高水分玉米粒青贮(去离子水CK、香兰素V、植物乳杆菌LP和短乳杆菌LB,n = 6/组)进行研究,并发现不同添加剂对青贮的代谢物、微生物群落、病毒和抗生素抗性基因分布均有一定的影响。 结果1添加剂对微生物群落的影响 对甜玉米青贮饲料表面微生物和...
中国科学院微生物研究所王军研究员和动物所宋默识研究员为共同通讯作者;中国科学院微生物研究所助理研究员陈亮和赵娜,博士研究生曹家宝,硕士研究生刘小林等为第一作者;上海百趣代谢组学技术研究中心创始团队刘志鹏研究员和研究人员范艳群为论文共同作者。 该研究建立了ONT三代测序和Illumina二代测序数据混合组装的新方法...