若已有目标代谢物,直接从代谢组结果中挑选目标代谢物即可;若没有目标代谢物,可以通过差异分析、KEGG富集分析、WGCNA分析等方式筛选出核心代谢物作为目标代谢物。也可以通过O2PLS模型对两个组学进行关联,通过两组间元素关联荷载图同时筛选出两个组学中重要性排名靠前的物种与代谢物。 找出目标代谢物与初步的目标物种后,...
代谢组是指对生物体内代谢物质进行全面的检测和定量分析的方法。代谢组学可以发现和解释生物体内代谢物质的变化及其与生物功能和疾病发生发展的关联。代谢组学研究一般包括样品采集、代谢物质提取、检测和分析等步骤,可以获得大量代谢物质数据,并进行数据挖掘、关联分析等研究。 宏基因组和代谢组两种方法在研究生物组成和功...
代谢组分析结果显示,生茶与发酵后的代谢物组成有显著差异,表明发酵过程对茶叶中的代谢物组成发生了显著变化(图1A)。 代谢物差异分析结果显示,发酵后有20种代谢物的含量降低,如,表没食子儿茶素没食子酸酯、表儿茶素没食子酸酯、表没食子儿茶素、茶氨酸、山柰酚和丝氨酸;13种代谢物的含量有所增加,如,酒石酸、没...
1、发现队列中 CRC 和腺瘤患者的血清代谢物显著改变对发现队列样本进行非靶代谢组分析发现C vs N 组与 A vs N 组中差异代谢物有明显的相似性，表明在腺瘤阶段的肿瘤就已经诱导了血清代谢组显著变化（图1E）。这些差异代谢物（共1426个）称为“结直肠异常相关代谢物”，其中可以注释到数据库中有885个代谢物，...
①可以通过功能通路分析挖掘与疾病相关微生物：将在KEGG中注释到初级胆汁酸代谢通路ko00120和次级胆汁酸代谢通路ko00121的所有基因构建基因集，进一步进行物种注释和功能注释，再进行后续的统计学分析，可以将后续的分析锁定在胆汁酸代谢相关的微生物和功能上。大大减少宏基因组数据挖掘的难度。②通过宏基因组的代谢通路组...
同时，使用DNA提取和宏基因组测序来研究两种类型谷物的微生物群落，并揭示了异味化合物与关键微生物之间的关系，以及关键异味化合物的潜在代谢途径。02 结果讨论 研究结果表明，正常发酵谷物与异味发酵谷物在感官特性和理化指标上存在显著差异。通过比较微生物群落，发现正常和异常发酵谷物之间的细菌和真菌群落结构存在显著...
研究联合利用了宏基因组与代谢组学技术，深入分析了金种子白酒中发酵谷物和窖泥微生物组成与挥发性化合物之间的相关性，揭示了核心菌群与挥发性化合物高度相关，这些发现有助于优化发酵过程、提升复合香型白酒质量，并为改进生产技术、解析发酵机制以及理解白酒发酵过程中微生物生态系统的复杂性提供了科学依据，同时结合了...
3、二肽水平和微生物组介导的BA修饰在中度/重度疾病中发生了显著变化 在中度/重度疾病中,二肽和微生物介导的BA修饰发生了显著变化。一些代谢物在中度/重度疾病中的粪便中含量不同,包括二肽和共轭型BA。本研究使用了105种二肽标准库来鉴定系统性增加的二肽在中度/重度疾病中的数量,包括Pro-Ala/Ala-Pro、Val-Pro...
可见，肠道菌群在氨基酸代谢中起着关键作用，尤其是这2年，对于肠道菌群参与的色氨酸代谢衍生物（如吲哚丙酸）的研究频频登上CNS主刊。通过宏基因组+代谢组学结合的研究方式，可以对氨基酸在代谢活动中变化、宿主代谢变化等多维度监测，全面解读微生物代谢与宿主之间相关联系，探索微生物-代谢产物-宿主三者之间互作机制。
● 宏基因组-代谢组的联合分析可以用来解释差异菌群与差异代谢物的关联性; ● 从而帮助建立微生物-代谢物-表型之间的逻辑关系。 凌恩生物的宏基因组学引入了宏观生态的研究理念,对环境中微生物菌群的多样性、功能活性等宏观特征进行研究,可以更准确地反应出微生物生存的真实状态;生信团队拥有10余年经验,1对1项目服...