图注:A、使用ChIP-Seq鉴定的远端H3K4me1组蛋白标记鉴定了鼠ES细胞中的细胞类型特异性增强子:基于H3K4me1富集和非H3K4me3富集的的热图选出25,036个推定增强子。B、缺乏H3K27ac富集的增强子近端基因与平均增强子近端基因相比表现出较低的表达水平,表明H3K27ac是区分活性和平衡增强子状态的良好标志。C、选择富含H3K27a...
因此可通过CHIP-seq分析组蛋白修饰的分布寻找基因的启动子区和增强子区域及其是激活或抑制基因表达。 H3K4me1可作为增强子的标志,H3K4me3作为启动子标志。研究表明,H3K4me1和H3K4me3与基因激活相关,H3K4me3主要富集在转录起始位点附近的启动子区域,而大多数H3K4me1修饰富集在增强子区域;H3K27ac与基因激活相关,主要富集在增...
因此可通过CHIP-seq分析组蛋白修饰的分布寻找基因的启动子区和增强子区域及其是激活或抑制基因表达。 H3K4me1可作为增强子的标志,H3K4me3作为启动子标志。研究表明,H3K4me1和H3K4me3与基因激活相关,H3K4me3主要富集在转录起始位点附近的启动子区域,而大多数H3K4me1修饰富集在增强子区域;H3K27ac与基因激活相关,主要富集在增...
因此可通过CHIP-seq分析组蛋白修饰的分布寻找基因的启动子区和增强子区域及其是激活或抑制基因表达。 H3K4me1可作为增强子的标志,H3K4me3作为启动子标志。研究表明,H3K4me1和H3K4me3与基因激活相关,H3K4me3主要富集在转录起始位点附近的启动子区域,而大多数H3K4me1修饰富集在增强子区域;H3K27ac与基因激活相关,主要富集在增...
学习文章:如何通过CHIP-seq分析鉴别基因启动子和增强子 - 简书 (jianshu.com) 一、表观遗传学的组蛋白修饰 染色体一个核小体由两个H2A,两个H2B,两个H3,两个H4组成的组蛋白八聚体和147bp缠绕在外面的DNA组成。组蛋白有很多修饰形式,包括组蛋白末端的乙酰化、甲基化、磷酸化、泛素化、ADP核糖基化等等,这些修饰...
二、组蛋白修饰的CHIP-seq分析方法区分增强子和启动子 组蛋白修饰能预测染色质的类型(异染色质或常染色质)、区分基因组功能元件(启动子、增强子、基因主体)以及检测决定这些元件处于活性状态或是抑制状态。例如H3K4me2和H3K4me3修饰大多数富集在转录起始位点附近的启动子上激活基因表达,而H3K27me2和H3K27me3与基因抑...
启动子 是RNA 聚合酶识别、结合和开始转录的一段DNA 序列，它含有RNA 聚合酶特异性结合和转录起始所需的保守序列，一般位于转录起始位点的上游。 增强子 是指能够使基因转录频率明显增加的 DNA序列，是关键的调控元件，可以影响基因转录，而与其方向或距离无关，增强子通常可以远离...