单细胞测序技术以单个细胞作为对象,通过对单个细胞遗传物质均匀扩增,标记建库后进行测序,最后对单个细胞基因组或转录组展开数据分析,其技术原理主要包括单细胞分离、扩增测序和数据分析3方面。 单细胞分离:主要包括荧光激活细胞分选法( flow- activated cell sorting ,FACS) 以及微流控分选法( microfluidics) 等。市场上...
10×genomics技术可用于单细胞mRNA测序,对RNA质量要求高,RNA降解会引起5’端信息丢失,有分子标签功能。 Anydeplete技术可用于单细胞mRNA及LncRNA测序,对RNA质量要求不高,可用于降解性样本测序。
分离、捕获单细胞:常见的单细胞分离捕获技术包括荧光激活细胞分选 (FACS)、磁激活细胞分选、微流体系统和激光显微切割。提取RNA:使用特定的试剂盒或技术将单个细胞中的RNA提取出来,进行质量检测和定量分析。逆转录和扩增:使用逆转录酶将RNA转化为cDNA,通常通过PCR或者体外扩增(IVT)进行扩增,以增加信号强度和覆盖度...
一、单细胞转录组测序技术原理 单细胞转录组测序技术是近年来兴起的一种基因测序技术,主要分为以下几个步骤: (一)单细胞的分选 单细胞的分选是单细胞转录组测序技术中非常重要的一步。它可以选择细胞类型,进行单细胞的分选,可以使用显微镜或流式细胞仪进行分选。当我们完成细胞分选后,需要解离细胞,进行cDNA合成,采用...
单细胞转录组测序技术是指对单个细胞进行RNA测序的技术,因此需要将细胞进行简单的分离。可使用离心、离子交换、贴壁等方式进行细胞的分离。不同的细胞类型在细胞膜蛋白、表观遗传标记等方面各不相同,因此需要针对不同的细胞类型使用不同的筛选方法,如基于荧光分选或微流控芯片分选等。 单细胞的捕获是单细胞转录组测序...
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第1步:了解分子生物学和遗传学的基础知识。例如dna、rna、蛋白质、基因组和转录组。这些概念是你后面学习和处理生物信息数据时所需要掌握的基础知识。 第2步:了解目前的高通量测序各种技术原理和单细胞测序技术原理。 第3步:熟悉linux操作系统以及终端命令 ...
单细胞测序主要涉及单细胞基因组测序和转录组测序两个方面,分别针对单细胞DNA及RNA进行序列分析和比较。单细胞测序一直是科学家关注的一个热点。单细胞基因组测序目前主要有两种扩增方法:MALBAC方法及MDA方法,而单细胞转录组目前主要有三种方法:SMART扩增技术、10×genomics技术及Andeplete技术。