一个解决办法就是双端测序,对一个长为 500 bp 的序列,单端测序下游质量会很差,但是从两个方向上分别测 250 bp-300 bp 然后再拼接起来,就可以大大提高测序的准确率了。双端测序的测序的接头序列要复杂一些,首先为了两个方向上分别进行测序,就需要有两个不同方向的测序引物(下图 Rd1 SP 和 Rd2 SP);其次,...
单端测序:Single-Read测序(Single-read)首先将DNA样本进行片段化处理形成200-500bp的片段,引物序列连接到DNA片段的一端,然后末端加上接头,将片段固定在flowcell上生成DNA簇,上机测序单端读取序列。该方式建库简单,操作步骤少,常用于小基因组、转录组、宏基因组测序。 双端测序:双端测序在DNA片段两端都加上接头,进行...
单细胞RNA测序(scRNA-seq) 能够在日益增长的实验需求中对细胞状态和通路进行研究和表征。捕获和处理单细胞文库的方法在过去几年里得到极大的进步,但测序本身很大程度上仍依赖于Illumina技术。 近日,美国Broad研究所的Joshua Z. Levin课题组在Nature Biotechnology上发表了题为Mostly natural sequencing-by-synthesis for ...
srr_ftp_url=$1 srr_list=$2 my_current_env=$3 sra_dir=/media/whq/282A932A2A92F3D2/WHQ/mysradata/sra/srafile/sra genome=/media/whq/282A932A2A92F3D2/WHQ/reference_genome/Homo_sapiens.GRCh38.dna.toplevel.fa gtf=/media/whq/282A932A2A92F3D2/WHQ/reference_index/ensembl_GRCH38_hisa...