转录组/蛋白组+代谢联合分析策略包括: (1)代谢物和编码代谢物的上游基因/蛋白的表达一致性分析,从而解析代谢物编码基因/蛋白对下游代谢物的影响; (2)转录/蛋白和代谢物的表达相关性分析,从而揭示mRNA和代谢物在表达水平上的相关性,从而反应其在生物学过程或疾病进程中发挥的协同或者抑制作用; (3)分析不同作用因子...
转录组+蛋白组的联合分析的从差异基因和差异蛋白入手进行关联分析,使用KEGG的注释信息来对转录组和蛋白组进行关联,注释到同一个KEGG Functional ortholog编号(K 开头的编号)的基因和蛋白被记为一对有关联的基因和蛋白。如果使用转录组数据建库,得到的蛋白ID与转录本ID格式相同,通过人为指定的方式将基因和蛋白一一对应起...
转录组代表了基因表达的中间状态,可以反映诸如转录调控、转录后调控的机理;蛋白组代表生物体直接功能执行状态,可以反应转录本真实的表达情况;而代谢组可以反映生物体表型的状态变化。转录组+蛋白组+代谢组的多组学分析可以同时实现从“因”和“果”两个层面来探究生物学问题,相互间进行验证,从海量的数据中筛选出关键...
蛋白组分析结束后,接下来就是转录组和蛋白组联合分析了,点击联合分析-与转录组联合-选中需要联合的转录组数据项目,提交即可。 转录组和蛋白组联合分析后的结果如下: 03 代谢组APP如何使用? 首先,您需要登录到百迈客云平台网址(http://www.biocloud.net/),点击全部导航->分析->农学 在农学分析各平台右侧选择代...
题目:Transcriptomic, proteomic, and metabolomic landscape of positional memory in the caudal fin of zebrafish 期刊:PNAS 影响因子:9.504 主要技术:转录组、蛋白质组(Label free)、代谢组 研究背景 在…
在中心法则中,RNA处于重要的中央枢纽地位,转录组作为生信科研中的“万金油”,几乎可以与所有的组学产品联合分析。转录组代表了基因表达的中间状态,可以反映诸如转录调控、转录后调控的机理;蛋白组代表生物体直接功能执行状态,可以反应转录本真实的表达情况;而代谢组可以反映生物体表型的状态变化。转录组+蛋白组+代谢组的...
在中心法则中,RNA处于重要的中央枢纽地位,转录组作为生信科研中的“万金油”,几乎可以与所有的组学产品联合分析。转录组代表了基因表达的中间状态,可以反映诸如转录调控、转录后调控的机理;蛋白组代表生物体直接功能执行状态,可以反应转录本真实的表达情况;而代谢组
转录组学和蛋白质组学都是获得基因表达情况的重要工具,从生物学角度上看,转录组代表了基因表达的中间状态,可以反映诸如转录调控、转录后调控的机理;而蛋白质是生物体直接的功能执行者,因而对其表达水平的研究有着不可替代的优势;代谢物与生理表型密切相关,常作为多组学系统研究的切入点。因此要全面探究生物体疾病机理...
选取前1000个基因、代谢物和所有蛋白质进行主成分分析。结果显示,疾病状态和年龄是导致转录组、蛋白质组和代谢组变化的主要因素(图2A-F)。显然,CHD-PBS综合征患者、CHD-NPBS综合征患者和健康成人在mrna、蛋白质和代谢物的表达上存在显著差异。在接下来的研究中,我们将定量描述这种差异,并确定不同组学之间的关联。
此外,对碳抑制条件下的叶片蛋白质组学和转录组学的联合分析结果发现了强烈的转录和转录后作用,并且这些蛋白水平差异主要受到自噬驱动,这再次揭示了碳应激期间的新陈代谢变化及自噬反应过程的重要性。 The atg12 Mutations and Fixed-Carbon Starvation Alter Starch/Cellulose Metabolism in Maize...