题目:Transcriptomic, proteomic, and metabolomic landscape of positional memory in the caudal fin of zebrafish 期刊:PNAS 影响因子:9.504 主要技术:转录组、蛋白质组(Label free)、代谢组 研究背景 在…
蛋白质组学和代谢组学结果表明,PAAD中多种代谢过程被异常调控,这种失调与TAM2浸润水平有关。WGCNA证实了丙酮酸和糖酵解/糖异生是TAM2在PAAD中共同表达的代谢途径。基于转录组数据,作者将PAAD样本分为4种与TAM2相关的代谢亚型。代谢亚型各具有临床预后、肿瘤微环境、免疫细胞浸润、化疗药物敏感性和功能机制等特征。
本研究使用亚硒酸盐和硒酸盐处理茶树后进行了转录组和蛋白质组测序和分析,获得了差异表达基因和差异表达蛋白。GO分析结果表明,Na2SeO3处理后,氨基酸和蛋白代谢、还原反应强烈上调。KEGG分析结果表明,参与氨基酸和谷胱甘肽代谢的基因上调,参与...
采用GO富集分析方法研究了油茶籽壳发育过程中蛋白质的功能分布。根据结果,所有鉴定的蛋白质被分为29类,主要涉及翻译和碳水化合物代谢。 (4)类黄酮和脂肪酸合成代谢相关分析 对基于iTRAQ的数据的分析揭示了八个被注释为参与脂肪酸代谢的转录因子的DAP,并且属于AP2和HDZIP家族的蛋白质都被下调。 为了阐明与油茶种子成...
近年来,单一的组学数据往往提供的是片面的视角。例如,转录组学主要集中于基因表达的变化,但它无法单独揭示细胞内的蛋白质表达或代谢物的变化。为了更全面地探索生物系统,研究人员开始将转录组与其他形式的组学(如蛋白质组、代谢组等)相结合。在这篇文章中,我们将回顾一些最新的研究案例,展示这一方法的潜力。
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