Hi-C：技术源于基因组捕获技术 ( Chromosome conformation capture) ，以整个细胞核为研究对象，利用高...
首先介绍一下三维基因组学的概念：它是基因组三维空间结构与功能研究的简称，旨在考虑基因组序列、基因结...
本报讯11月14日，华中农业大学作物遗传改良国家重点实验室教授李兴旺和李国亮课题组受邀在《植物科学趋势》在线发表了综述文章。三维基因组学是基因组学研究的热点前沿领域之一。目前，以人类细胞系和动物细胞为研究对象，生物学家已经开发了很多高通量的三维基因组学研究技术。其中一些技术体系已经成功应用于植物三维基因组...
三维基因组学的技术实现与应用研究 刘涵(中科院植物所) 主要内容 [图片] 三维基因组学的概念、产生背景和研究对象: [图片] [图片] 研...
三维基因组结构的研究得益于单细胞技术和成像技术的突破,特别是单细胞Hi-C技术,它使得研究者能够在单细胞层面上探测到染色质结构的变异性。与此同时,多重DNA FISH成像技术能够追踪大量基因组位点的空间位置,但由于技术限制,探针信号的缺失现象尤其严重,有时缺失率甚至高达62%。这显著影响了基因组信息的完整性和准确...
该研究揭示了跨染色质结构域互作存在的广泛性,并且突出了HiPore-C技术在单分子水平解析基因组三维高阶互作的优势和重要性。 图3. 跨越染色质环的高阶互作。 研究团队通过分层聚类的方法,讨论了不同类型细胞的拓扑结构中呈现的单分子拓扑结构集群, 这些结构集群是类亚TAD(subTAD-like)结构域形成的基础,往往具有明显...
最前沿的三维基因组学研究技术—Hi-C测序.docx,最前沿的三维基因组学研究技术—Hi-C测序 Hi-C技术源于染色体构象捕获 (Chromosome conformation capture,3C)技术,以整个细胞核为研究对象,利用高通量测序技术,结合生物信息分析方法,研究全基因组范围内整个染色质DNA在
基因表达调控基因组DNA在细胞核中并不是呈线性的一字排列,而是以三维结构高度折叠并浓缩成染色质的方式储存于核内,具有特定的高级空间结构和构象.高通量染色体构象捕获(high-througnput chromosome conformationcapture,Hi-C)技术于2009年首次被提出,目前已得到大规模运用,使得人们对于三维基因组学有了更深刻的认识.研究...
研究绘制了水稻昼夜动态变化的高分辨率三维基因组图谱,系统阐释了昼夜动态变化的三维基因组结构对节律基因转录调控的影响。 课题组前期系统地解析了水稻等模式植物不同组织的线性表观基因组和三维基因组结构这些相对“静态”的核内染色质组织形式。事实上,真核生物的三维基因组结构随时序(如昼夜节律 、 发育阶段等)发生...
吴昊副教授团队长期致力于复杂疾病通路、三维基因组结构及相关调控元件预测和单细胞多组学数据集成及下游分析等相关研究,近期系列研究成果发表于Nucleic Acids Research(2022) (中科院1区, Top期刊, IF=19.16),Briefings in Bioinformatics(2022) (中科院1区, Top期刊, IF=13.99),Bioinformatics(2022) (中科院1区, Top...