基因组三维空间结构与功能的研究简称三维基因组学(Three-Dimensional Genomics, 3D Genomics)。2003年Job Dekker及其合作者提出了染色质构象捕获技术(Chromatin Conformation Capture, 3C),用于测定特定的点到点之间的染色质交互作用。随后,科学家们扩展了3C技术,开发了4C技术(Circularized Chromatin Conformation Capture),用...
Hi-C：技术源于基因组捕获技术 ( Chromosome conformation capture) ，以整个细胞核为研究对象，利用高...
三维基因组学的进展史也可以说是我们对于染色质结构分辨率的不断提升的过程，最开始我们认识到染色质在细...
三维基因组学的技术实现与应用研究 刘涵(中科院植物所) 主要内容 [图片] 三维基因组学的概念、产生背景和研究对象: [图片] [图片] 研...
三维基因组学是基因组学研究的热点前沿领域之一。目前，以人类细胞系和动物细胞为研究对象，生物学家已经开发了很多高通量的三维基因组学研究技术。其中一些技术体系已经成功应用于植物三维基因组学研究。李兴旺和李国亮课题组致力于三维基因组学和表观基因组学研究。前期，他们以人类细胞系和动物细胞为研究材料，先后开发...
利用Hi-C技术寻找差异染色质相互作用常常面临数据的稀疏性、高噪音和较少的生物学重复等困难。针对这些问题,该研究设计了SimpleDiff策略,通过对两组重构的单细胞全基因组三维结构中两点之间的空间距离进行非参检验的方式,可以高效检测染色质差异相互作用(differential interaction,DI)。基于该方法,研究人员发现染色质结构...
2024年11月7日,第11届国际三维基因组学研讨会在美丽的海滨城市三亚成功举行。此次研讨会吸引了众多来自世界各地的专家学者,旨在探讨三维基因组技术在基础研究、临床医学以及生物技术等领域的最新进展与应用,推动全球基因组学研究的协作与创新。 此次研讨会的主题明确,围绕三维基因组结构如何影响基因调控机制、细胞功能乃至...
巧用“分子剪刀”实现三维基因组学技术“降噪” 科技日报记者 瞿剑 据中国农科院最新消息,该院深圳农业基因组研究所动物功能基因组学创新团队,提出一种利用外切酶组合(又称“分子剪刀”)降低三维基因组学系列技术(C-技术)“噪音”的新策略,可有效提高基因功能解读准确性。相关成果新近在线发表于《核酸研究(Nucleic...
2020年3月4日,《Nucleic Acids Research》杂志在线发表了基因组所动物功能基因组学创新团队的研究成果,这篇题为“Exonuclease combinations reduce noises in 3D genomics technologies”的学术论文,提出了一种利用外切酶组合降低三维基因组学系列技术(C-技术)噪音的新策略。
最前沿的三维基因组学研究技术—Hi-C测序.docx,最前沿的三维基因组学研究技术—Hi-C测序 Hi-C技术源于染色体构象捕获 (Chromosome conformation capture,3C)技术,以整个细胞核为研究对象,利用高通量测序技术,结合生物信息分析方法,研究全基因组范围内整个染色质DNA在